More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2662 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  100 
 
 		 538 aa  1070    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  51.07 
 
 		 534 aa  450  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  50.89 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  44.17 
 
 		 509 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  52 
 
 		 427 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  52 
 
 		 427 aa  236  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  48.25 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  45.52 
 
 		 412 aa  219  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  38.26 
 
 		 397 aa  197  6e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  36.19 
 
 		 453 aa  184  3e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  33.17 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  35.77 
 
 		 464 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  42.74 
 
 		 478 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  40.59 
 
 		 471 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  41.06 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  42.74 
 
 		 449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  41.91 
 
 		 474 aa  163  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  35.14 
 
 		 447 aa  155  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  31.4 
 
 		 509 aa  147  6e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  38.91 
 
 		 394 aa  144  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  48.36 
 
 		 465 aa  139  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  36.44 
 
 		 328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  52.5 
 
 		 501 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  44.15 
 
 		 537 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  50 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  51.24 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  50 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  29.09 
 
 		 430 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  50 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  33.6 
 
 		 293 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  50.83 
 
 		 494 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  35.87 
 
 		 250 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  32.94 
 
 		 323 aa  128  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  35.43 
 
 		 251 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  35.43 
 
 		 251 aa  127  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  35.43 
 
 		 251 aa  127  5e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  35.43 
 
 		 251 aa  127  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  35.43 
 
 		 251 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  35.06 
 
 		 251 aa  123  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  30.94 
 
 		 633 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  31.92 
 
 		 297 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.43 
 
 		 274 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  33.92 
 
 		 251 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  33.92 
 
 		 251 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  33.92 
 
 		 251 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  32.63 
 
 		 285 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  34.04 
 
 		 296 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  34.3 
 
 		 294 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  35.56 
 
 		 291 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  33.61 
 
 		 252 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  33.2 
 
 		 262 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  32.77 
 
 		 262 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  32.83 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  32.83 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  32.83 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  32.83 
 
 		 377 aa  116  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  32.83 
 
 		 377 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  33.33 
 
 		 288 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  33.04 
 
 		 250 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  34.71 
 
 		 284 aa  116  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  34.21 
 
 		 294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1756  peptidase M23B  36.32 
 
 		 272 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657093  decreased coverage  0.0000000551494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  32.79 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  35.17 
 
 		 261 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  30.94 
 
 		 250 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  32.59 
 
 		 250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  34.04 
 
 		 286 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  32.59 
 
 		 250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  33.75 
 
 		 292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  32.59 
 
 		 250 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  30.53 
 
 		 379 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  30.53 
 
 		 379 aa  114  6e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  33.19 
 
 		 298 aa  114  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  30.53 
 
 		 379 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  30.53 
 
 		 363 aa  114  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  30.53 
 
 		 379 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  34.01 
 
 		 315 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  30.53 
 
 		 379 aa  114  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  33.19 
 
 		 296 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  33.19 
 
 		 296 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  33.19 
 
 		 296 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  33.88 
 
 		 317 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  33.19 
 
 		 296 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  33.19 
 
 		 296 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  33.19 
 
 		 292 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  32.4 
 
 		 310 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  33.19 
 
 		 230 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  33.46 
 
 		 270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  32.91 
 
 		 288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  31.91 
 
 		 295 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  34.87 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  32.34 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  32.16 
 
 		 265 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  32.34 
 
 		 296 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1284  putative lipoprotein NlpD  33.6 
 
 		 315 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0528  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  33.6 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.427762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  45.45 
 
 		 198 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0258  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  33.6 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1039  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  33.6 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  30.15 
 
 		 379 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>