More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1493 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  100 
 
 		 530 aa  1054    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  89.7 
 
 		 534 aa  896    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  50.45 
 
 		 538 aa  438  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  47.98 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  50.36 
 
 		 427 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  50.36 
 
 		 427 aa  254  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  48.43 
 
 		 438 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  44.98 
 
 		 412 aa  216  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  37.31 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  43.53 
 
 		 484 aa  180  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  32.67 
 
 		 500 aa  178  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  34.53 
 
 		 453 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  42.5 
 
 		 464 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  60.16 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  62.5 
 
 		 474 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  39.42 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  41.22 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  36.64 
 
 		 447 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  36.53 
 
 		 328 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  36.49 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.49 
 
 		 509 aa  143  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  48.36 
 
 		 465 aa  143  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  34.78 
 
 		 323 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  50.83 
 
 		 446 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  50.83 
 
 		 451 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  50.83 
 
 		 455 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  50.83 
 
 		 501 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  50.83 
 
 		 537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  50.83 
 
 		 494 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  33.68 
 
 		 633 aa  130  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  32.45 
 
 		 374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  27.3 
 
 		 430 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  33.74 
 
 		 293 aa  126  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  33.05 
 
 		 251 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  33.05 
 
 		 251 aa  126  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  30.6 
 
 		 345 aa  126  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  33.05 
 
 		 251 aa  126  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  33.05 
 
 		 251 aa  126  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  33.05 
 
 		 251 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  32.63 
 
 		 250 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  34.73 
 
 		 377 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  33.06 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  34.73 
 
 		 377 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  34.73 
 
 		 377 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  34.73 
 
 		 377 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  33.97 
 
 		 377 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  34.36 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  34.36 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  34.36 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  34.36 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  34.36 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.62 
 
 		 274 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  34.36 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  31.85 
 
 		 262 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  31.85 
 
 		 262 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  30.86 
 
 		 327 aa  121  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  31.58 
 
 		 307 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  30.86 
 
 		 327 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  34.32 
 
 		 251 aa  121  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  34.32 
 
 		 251 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  34.32 
 
 		 251 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  31.03 
 
 		 297 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  32.63 
 
 		 250 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  34 
 
 		 298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  32.2 
 
 		 250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  32.2 
 
 		 250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  32.2 
 
 		 250 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  30.86 
 
 		 327 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  32.82 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  32.82 
 
 		 363 aa  118  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  32.82 
 
 		 379 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  32.93 
 
 		 317 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  32.68 
 
 		 291 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  35.27 
 
 		 294 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  31.85 
 
 		 285 aa  117  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  31.39 
 
 		 344 aa  116  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  30.92 
 
 		 296 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  30.74 
 
 		 298 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  32.48 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  32.48 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  32.48 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  32.48 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  32.48 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  32.48 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  31.68 
 
 		 309 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  32.48 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  31.46 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  30.93 
 
 		 250 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  30.07 
 
 		 401 aa  115  3e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  29.39 
 
 		 285 aa  114  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  31.56 
 
 		 307 aa  114  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  31.35 
 
 		 315 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  31.68 
 
 		 328 aa  114  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  30.77 
 
 		 298 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 279 aa  113  7.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  31.38 
 
 		 284 aa  113  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  31.6 
 
 		 310 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  30.04 
 
 		 249 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  29.96 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  29.96 
 
 		 298 aa  111  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>