More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1767 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  100 
 
 		 465 aa  906    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  56.52 
 
 		 464 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  60.16 
 
 		 478 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  59.35 
 
 		 474 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  59.02 
 
 		 484 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  58.27 
 
 		 328 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  55.07 
 
 		 453 aa  168  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  58.2 
 
 		 449 aa  166  9e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  46.38 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  53.25 
 
 		 500 aa  161  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  59.84 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  52.11 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  50.97 
 
 		 394 aa  149  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  52.89 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  52.03 
 
 		 446 aa  147  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  54.17 
 
 		 494 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  50.41 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  26.39 
 
 		 602 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  50.41 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  48.36 
 
 		 534 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  48.36 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  50.39 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  43.02 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  43.02 
 
 		 427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  47.54 
 
 		 509 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  48.36 
 
 		 538 aa  140  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  32.54 
 
 		 360 aa  140  6e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  50 
 
 		 292 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  47.46 
 
 		 438 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0370  peptidase M23B  35 
 
 		 376 aa  136  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  51.24 
 
 		 312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  51.67 
 
 		 295 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  52.07 
 
 		 298 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  52.07 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  52.07 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  52.07 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  45.33 
 
 		 270 aa  134  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  45.51 
 
 		 633 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  52.07 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  52.07 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  52.07 
 
 		 292 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  45.51 
 
 		 293 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  32.34 
 
 		 401 aa  134  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  51.67 
 
 		 295 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  46.84 
 
 		 294 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  51.24 
 
 		 292 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  43.11 
 
 		 252 aa  131  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  50.83 
 
 		 296 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  50.83 
 
 		 296 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  46.62 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  50.83 
 
 		 296 aa  131  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  35.48 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  50.83 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  28.92 
 
 		 310 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  39.23 
 
 		 327 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  38.01 
 
 		 307 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  39.23 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  48 
 
 		 311 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  39.23 
 
 		 327 aa  128  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  45.19 
 
 		 309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  43.27 
 
 		 285 aa  128  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  43.57 
 
 		 411 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  46.72 
 
 		 344 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  45 
 
 		 290 aa  125  1e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  42.94 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  34.52 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  43.61 
 
 		 304 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  42.59 
 
 		 262 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  43.04 
 
 		 262 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  37 
 
 		 374 aa  124  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  36.65 
 
 		 296 aa  124  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2632  peptidase M23B  30.53 
 
 		 367 aa  124  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  46.28 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  46.28 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  46.28 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  46.28 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  38.54 
 
 		 345 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  46.28 
 
 		 377 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  37.14 
 
 		 289 aa  123  8e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  34.04 
 
 		 294 aa  123  8e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  47.58 
 
 		 452 aa  123  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  40.91 
 
 		 250 aa  122  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  41.18 
 
 		 251 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  41.18 
 
 		 251 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  41.18 
 
 		 251 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  35.03 
 
 		 298 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  48.03 
 
 		 233 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.03 
 
 		 233 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  44.62 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.03 
 
 		 233 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  41.18 
 
 		 251 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  48.03 
 
 		 233 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  49.59 
 
 		 299 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  41.18 
 
 		 251 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  48.41 
 
 		 296 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  44.29 
 
 		 251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  37.72 
 
 		 298 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  48.03 
 
 		 236 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  33.82 
 
 		 298 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  33.82 
 
 		 298 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>