More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1171 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  100 
 
 		 509 aa  1012    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  48.62 
 
 		 530 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  49.26 
 
 		 534 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  44.17 
 
 		 538 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  52.12 
 
 		 427 aa  230  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  52.12 
 
 		 427 aa  229  8e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  46.4 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  45.13 
 
 		 412 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  35.6 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  34.66 
 
 		 500 aa  196  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  40.77 
 
 		 397 aa  190  5e-47  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  44.77 
 
 		 464 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  42.74 
 
 		 449 aa  176  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  39.75 
 
 		 478 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  54.17 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  52.89 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  54.17 
 
 		 455 aa  144  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  53.33 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  34.59 
 
 		 447 aa  144  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  39.82 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  52.5 
 
 		 501 aa  140  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  34.8 
 
 		 323 aa  140  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  52.5 
 
 		 537 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  47.54 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  33.58 
 
 		 328 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  50.83 
 
 		 494 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  28.46 
 
 		 509 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  35.29 
 
 		 291 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  34.02 
 
 		 294 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  33.47 
 
 		 292 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  27.93 
 
 		 430 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  30.8 
 
 		 274 aa  121  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  33.88 
 
 		 293 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  32.06 
 
 		 633 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  32.9 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  27.36 
 
 		 727 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  27.36 
 
 		 727 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  31.66 
 
 		 452 aa  117  5e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  32.34 
 
 		 262 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  35.04 
 
 		 295 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  32.34 
 
 		 262 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  30.98 
 
 		 298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  33.33 
 
 		 250 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  30.98 
 
 		 298 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  30.29 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  32.51 
 
 		 297 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  32.77 
 
 		 251 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  32.77 
 
 		 251 aa  115  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  32.27 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  32.77 
 
 		 251 aa  115  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  32.77 
 
 		 251 aa  115  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  33.33 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  30.98 
 
 		 298 aa  114  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  32.77 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  34.8 
 
 		 298 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  33.19 
 
 		 279 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1043  lipoprotein NlpD  30.92 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.859563 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  30.59 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1793  peptidase M23B  29.66 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.532041  normal  0.0360441 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  32.02 
 
 		 298 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  34.8 
 
 		 317 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  34.62 
 
 		 295 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  32.69 
 
 		 310 aa  110  6e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  31.38 
 
 		 312 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  31.6 
 
 		 284 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  33.05 
 
 		 251 aa  110  9.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  33.05 
 
 		 251 aa  110  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  45.45 
 
 		 195 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  32.63 
 
 		 251 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  30.77 
 
 		 315 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  32.62 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  32.62 
 
 		 292 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  32.62 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  32.62 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  32.62 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  32.77 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  32.62 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  30.3 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  32.62 
 
 		 296 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  31.75 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  31.75 
 
 		 298 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  42.15 
 
 		 198 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  32.79 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  30.77 
 
 		 284 aa  107  7e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  32.5 
 
 		 293 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  42.15 
 
 		 198 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  31.37 
 
 		 252 aa  106  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  32.54 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  31.34 
 
 		 270 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 		 590 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1059  peptidase M23B  32.82 
 
 		 309 aa  106  1e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  31.91 
 
 		 285 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  32.13 
 
 		 294 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  32.06 
 
 		 296 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  31.06 
 
 		 250 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  29.44 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  28.27 
 
 		 285 aa  103  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  31.17 
 
 		 250 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  29.89 
 
 		 409 aa  103  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  32.34 
 
 		 256 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>