More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0639 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  100 
 
 		 394 aa  770    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  37.72 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  35.87 
 
 		 323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  33.62 
 
 		 453 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  32.51 
 
 		 474 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  31.99 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  32.61 
 
 		 471 aa  149  9e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  37.8 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  32.71 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  37.36 
 
 		 530 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  38.8 
 
 		 534 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  38.24 
 
 		 284 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  51.06 
 
 		 465 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  34.18 
 
 		 285 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  51.85 
 
 		 494 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  38.36 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  50.83 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  36.54 
 
 		 298 aa  135  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  54.1 
 
 		 501 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  33.45 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  50 
 
 		 538 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  35.91 
 
 		 298 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  33.09 
 
 		 262 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  51.67 
 
 		 446 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  37.34 
 
 		 293 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  50.83 
 
 		 451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  35.42 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  50.83 
 
 		 455 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  37.5 
 
 		 427 aa  130  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  30.93 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  34.02 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  37.5 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  34.15 
 
 		 290 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  35.27 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  35.27 
 
 		 298 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  35.98 
 
 		 438 aa  126  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  34.39 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  31.07 
 
 		 283 aa  125  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  49.17 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  36.29 
 
 		 246 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  31.44 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  31.44 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  31.44 
 
 		 377 aa  124  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3272  peptidase M23B  33.73 
 
 		 298 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.601855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  31.44 
 
 		 377 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2750  peptidase M23B  34.66 
 
 		 294 aa  123  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  32 
 
 		 377 aa  123  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3120  peptidase M23B  34.51 
 
 		 298 aa  123  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  48.76 
 
 		 417 aa  123  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  33.19 
 
 		 509 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3343  peptidase M23B  32.94 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  unclonable  0.00000001454 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  32.48 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  32.48 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  32.48 
 
 		 363 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  32.48 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  27.88 
 
 		 374 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  32.48 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  28.63 
 
 		 285 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  32.48 
 
 		 379 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  34.48 
 
 		 301 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  34.68 
 
 		 288 aa  119  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1244  Peptidase M23  34.25 
 
 		 298 aa  119  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000297961 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  36.32 
 
 		 751 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3129  peptidase M23B  34.65 
 
 		 298 aa  119  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.365869  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  30.2 
 
 		 265 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0871  Peptidase M23  29.04 
 
 		 401 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  34.05 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  36.02 
 
 		 373 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  32.43 
 
 		 296 aa  117  5e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  30.31 
 
 		 397 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  35.06 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  31.97 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  33.33 
 
 		 288 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  33.72 
 
 		 297 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  32.65 
 
 		 292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  33.47 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  32.33 
 
 		 257 aa  113  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1203  peptidase M23B  29.93 
 
 		 311 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000304892  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1793  peptidase M23B  34.69 
 
 		 426 aa  112  8.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.532041  normal  0.0360441 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3349  lipoprotein NlpD  30.66 
 
 		 344 aa  112  9e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0164165  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0946  Peptidase M23  31.02 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0564272  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2867  lipoprotein NlpD  31.02 
 
 		 379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3993  lipoprotein NlpD  31.02 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  31.05 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  45.45 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  45.45 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  30.08 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  31.25 
 
 		 328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  29.02 
 
 		 271 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  34.62 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  35.68 
 
 		 296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  43.8 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  31.9 
 
 		 250 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3506  lipoprotein NlpD  31.27 
 
 		 345 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  30.5 
 
 		 314 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  33.76 
 
 		 284 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  30.42 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  30.42 
 
 		 327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1297  peptidase M23B  33.2 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.353225  hitchhiker  0.00000000164338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  33.74 
 
 		 264 aa  110  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>