More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0888 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  100 
 
 		 427 aa  854    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  99.53 
 
 		 427 aa  848    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  80.82 
 
 		 438 aa  651    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  52.03 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  50.36 
 
 		 530 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  35.36 
 
 		 397 aa  248  2e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  47 
 
 		 534 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  50.99 
 
 		 538 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  52.12 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  41.9 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  40.91 
 
 		 453 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  40.59 
 
 		 471 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  39.92 
 
 		 484 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  41.49 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  38.75 
 
 		 474 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  38.51 
 
 		 447 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  56.67 
 
 		 449 aa  158  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  58.68 
 
 		 500 aa  150  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  57.85 
 
 		 417 aa  149  9e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  54.84 
 
 		 501 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  45.86 
 
 		 537 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  55.74 
 
 		 494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  36.96 
 
 		 323 aa  146  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  53.33 
 
 		 455 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  53.33 
 
 		 451 aa  144  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  52.5 
 
 		 446 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  38.16 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  49.15 
 
 		 465 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  39.83 
 
 		 509 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  36.4 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  36.69 
 
 		 252 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  34.16 
 
 		 291 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  34.52 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  37.5 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  34.96 
 
 		 297 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  33.47 
 
 		 285 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  32.95 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  48.36 
 
 		 294 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  32.22 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  34.11 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  47.54 
 
 		 292 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  37.55 
 
 		 295 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  34.02 
 
 		 297 aa  123  5e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  29.55 
 
 		 633 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  34.94 
 
 		 270 aa  123  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  34.16 
 
 		 262 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  52.03 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  32.02 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  36.05 
 
 		 295 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5357  peptidase M23B  34.45 
 
 		 297 aa  121  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.429427  normal  0.717977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  36.55 
 
 		 286 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  35.34 
 
 		 284 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  34.17 
 
 		 261 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  35.34 
 
 		 284 aa  120  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  31.49 
 
 		 283 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  32.65 
 
 		 279 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0497  peptidase M23B  30.5 
 
 		 360 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  34.24 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4488  peptidase M23  35.02 
 
 		 279 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  33.33 
 
 		 264 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4030  peptidase M23B  35.9 
 
 		 279 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  34.66 
 
 		 312 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  31.29 
 
 		 288 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  32.19 
 
 		 324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  30.77 
 
 		 582 aa  118  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1461  Peptidase M23  32.2 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  36.6 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  36.6 
 
 		 298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  36.6 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  37.29 
 
 		 274 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  36.6 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  36.6 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  36.6 
 
 		 296 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00162  lipoprotein  33.62 
 
 		 263 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.989449  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  36.6 
 
 		 292 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  33.33 
 
 		 315 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3768  peptidase M23B  33.33 
 
 		 289 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  33.33 
 
 		 289 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  32.91 
 
 		 419 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  30.55 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  46.22 
 
 		 198 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  33.2 
 
 		 293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1252  lipoprotein NlpD  32.63 
 
 		 260 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18696  normal  0.0631891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0661  peptidase M23B  32.14 
 
 		 270 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0851983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2577  peptidase M23B  33.62 
 
 		 301 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0480337  hitchhiker  0.00120984 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  31.93 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  34.15 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  35.86 
 
 		 292 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  30.42 
 
 		 250 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  34.71 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  34.32 
 
 		 349 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  45.38 
 
 		 198 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  30.25 
 
 		 285 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  30.42 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  29.88 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  29.88 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  29.88 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  30.08 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  30.08 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  29.88 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>