More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2208 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  100 
 
 
162 aa  316  9e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  71.6 
 
 
162 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  74.07 
 
 
161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  74.07 
 
 
161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  74.07 
 
 
161 aa  238  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  68.71 
 
 
249 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  56.29 
 
 
174 aa  156  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  56.3 
 
 
164 aa  141  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  54.81 
 
 
214 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  47.2 
 
 
169 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.17 
 
 
219 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  57.14 
 
 
331 aa  124  4.0000000000000003e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  52.76 
 
 
175 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  51.45 
 
 
174 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  52.59 
 
 
362 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  50.74 
 
 
191 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  50 
 
 
291 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  50 
 
 
139 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  47.97 
 
 
269 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  45.24 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  49.26 
 
 
211 aa  108  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  46.31 
 
 
254 aa  104  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  51.13 
 
 
170 aa  100  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  50.85 
 
 
223 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  42.38 
 
 
193 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  51.11 
 
 
177 aa  96.7  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  38.69 
 
 
195 aa  94.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  42 
 
 
271 aa  94.4  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  44.7 
 
 
193 aa  93.2  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  38.66 
 
 
170 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.75 
 
 
238 aa  89.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  45.67 
 
 
203 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  34.78 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  33.68 
 
 
447 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  33.68 
 
 
447 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0146  Peptidase M23  35.97 
 
 
230 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.518136  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  37.08 
 
 
491 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  42.05 
 
 
198 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  42.05 
 
 
198 aa  53.9  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  34.74 
 
 
446 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  37.19 
 
 
468 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  42.86 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  35.11 
 
 
233 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.11 
 
 
233 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.11 
 
 
233 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  34.51 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  34.78 
 
 
230 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  35.11 
 
 
236 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.11 
 
 
233 aa  52.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  35.11 
 
 
296 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  35.11 
 
 
296 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  38.32 
 
 
295 aa  51.6  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  44.16 
 
 
751 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  38.05 
 
 
250 aa  51.2  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  44.16 
 
 
590 aa  51.2  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  38.05 
 
 
250 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  38.05 
 
 
250 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  38.05 
 
 
250 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  40.85 
 
 
452 aa  50.8  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  41.56 
 
 
727 aa  50.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  38.96 
 
 
824 aa  50.4  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  41.56 
 
 
727 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  35.96 
 
 
411 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  33.04 
 
 
491 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  34.07 
 
 
295 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  40 
 
 
387 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  33.64 
 
 
333 aa  50.4  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  38.61 
 
 
238 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  37.17 
 
 
250 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  38.68 
 
 
253 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  39.47 
 
 
294 aa  50.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  37.04 
 
 
466 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  38.74 
 
 
262 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  38.68 
 
 
288 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  34.62 
 
 
288 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  38.74 
 
 
285 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  30.2 
 
 
286 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  42.7 
 
 
297 aa  49.7  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  38.74 
 
 
262 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  38.38 
 
 
509 aa  49.7  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  36.36 
 
 
296 aa  49.7  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  31.01 
 
 
482 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  43.84 
 
 
293 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  35.85 
 
 
249 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  42.11 
 
 
294 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  33.65 
 
 
376 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  33.03 
 
 
307 aa  48.9  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  42.47 
 
 
285 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  42.11 
 
 
292 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  37.93 
 
 
216 aa  48.1  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  37.04 
 
 
333 aa  48.5  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1516  hypothetical protein  43.84 
 
 
307 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  33.02 
 
 
290 aa  48.5  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  32.77 
 
 
442 aa  48.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  30.17 
 
 
395 aa  48.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  36.73 
 
 
240 aa  48.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  43.84 
 
 
297 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  38.82 
 
 
450 aa  47.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  51.06 
 
 
299 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>