206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4134 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  100 
 
 
162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  71.6 
 
 
162 aa  230  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  69.14 
 
 
161 aa  223  6e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  69.14 
 
 
161 aa  223  8e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  69.14 
 
 
161 aa  223  8e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  66.04 
 
 
249 aa  203  1e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  51.52 
 
 
174 aa  147  5e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  52.59 
 
 
169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  51.82 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  49.64 
 
 
214 aa  124  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  47.1 
 
 
219 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  53.57 
 
 
331 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  53.12 
 
 
175 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  47.68 
 
 
269 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  49.25 
 
 
139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  42.11 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  46.38 
 
 
191 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  42.76 
 
 
193 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  49.15 
 
 
223 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  55.47 
 
 
170 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  46.34 
 
 
291 aa  102  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  43.88 
 
 
174 aa  101  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  47.18 
 
 
362 aa  100  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  46.67 
 
 
211 aa  98.6  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  47.1 
 
 
177 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  38.13 
 
 
195 aa  92  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  42.97 
 
 
254 aa  89  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  42.42 
 
 
193 aa  88.6  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.45 
 
 
238 aa  88.6  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  37.29 
 
 
170 aa  87.8  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.96 
 
 
271 aa  84.3  7e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  32.61 
 
 
205 aa  81.6  0.000000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  44.17 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  34.38 
 
 
316 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  34.95 
 
 
491 aa  51.6  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  35.79 
 
 
446 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  36.05 
 
 
491 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  33.68 
 
 
447 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  36.28 
 
 
411 aa  51.2  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  38.46 
 
 
824 aa  51.2  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  33.68 
 
 
447 aa  51.2  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  37.65 
 
 
323 aa  51.2  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  40 
 
 
468 aa  50.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  36.47 
 
 
450 aa  50.8  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  31.71 
 
 
541 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  35.79 
 
 
389 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  36 
 
 
448 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1189  Peptidase M23  31.58 
 
 
441 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000449419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  31.09 
 
 
527 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  35.56 
 
 
353 aa  49.7  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  34.69 
 
 
296 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  31.75 
 
 
375 aa  48.9  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  31.58 
 
 
438 aa  48.5  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  28.89 
 
 
286 aa  47.4  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  29.81 
 
 
299 aa  47.4  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  37.65 
 
 
284 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  31.73 
 
 
299 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  32.23 
 
 
446 aa  47  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  34.92 
 
 
404 aa  47  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  34.41 
 
 
404 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  34.74 
 
 
509 aa  47  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  30.77 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  37.23 
 
 
400 aa  46.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  30.37 
 
 
293 aa  46.2  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  44.19 
 
 
605 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2079  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
435 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000207856  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  31.73 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  32.08 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  32.08 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  33.04 
 
 
379 aa  46.6  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  32.08 
 
 
299 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  31.73 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  31.73 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  31.73 
 
 
299 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  30.77 
 
 
299 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  35.92 
 
 
276 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  31.73 
 
 
299 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  37.66 
 
 
466 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  31.01 
 
 
469 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  30.21 
 
 
390 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  29.81 
 
 
299 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  36.76 
 
 
455 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  30.77 
 
 
299 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  40.23 
 
 
198 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  34.83 
 
 
452 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  34.41 
 
 
445 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  32.94 
 
 
299 aa  45.1  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  33.93 
 
 
402 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  38.89 
 
 
751 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.33 
 
 
376 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  26.5 
 
 
262 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  32.5 
 
 
299 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  33.64 
 
 
482 aa  44.7  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  31.76 
 
 
248 aa  44.7  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  34.17 
 
 
251 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  35.85 
 
 
256 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  39.08 
 
 
198 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  34.58 
 
 
295 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  36.05 
 
 
464 aa  44.7  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  33.71 
 
 
490 aa  44.7  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>