More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09880 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  55.41 
 
 		 174 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  55.07 
 
 		 161 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  55.07 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  55.07 
 
 		 161 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  58.87 
 
 		 291 aa  138  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  54.86 
 
 		 164 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  53.9 
 
 		 191 aa  132  5e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  53.52 
 
 		 214 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  52.17 
 
 		 162 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  52.17 
 
 		 249 aa  128  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  54.87 
 
 		 331 aa  126  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  56.69 
 
 		 175 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  54.11 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  49.31 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  47.1 
 
 		 162 aa  121  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  43.35 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  53.9 
 
 		 170 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  44.08 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  51.03 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.83 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  41.46 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  44.9 
 
 		 173 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  47.55 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  49.63 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  46.32 
 
 		 139 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  41.28 
 
 		 193 aa  95.9  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  49.15 
 
 		 254 aa  95.9  4e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  34.52 
 
 		 205 aa  92.4  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  50 
 
 		 177 aa  90.9  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  36.36 
 
 		 170 aa  88.2  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  47.14 
 
 		 362 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.8 
 
 		 271 aa  85.5  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  38.21 
 
 		 402 aa  65.9  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  38.4 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  38.4 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  37.04 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  42.42 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  44.44 
 
 		 597 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  35.14 
 
 		 379 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  42.98 
 
 		 294 aa  62  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  35.77 
 
 		 509 aa  61.6  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  42.98 
 
 		 292 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  46 
 
 		 592 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  42.98 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  38.89 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  35.29 
 
 		 615 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  33.09 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.1 
 
 		 448 aa  60.5  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  34.56 
 
 		 538 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  31.35 
 
 		 464 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  38.39 
 
 		 692 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  35.88 
 
 		 582 aa  59.3  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  36.61 
 
 		 680 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  31.51 
 
 		 445 aa  59.3  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.82 
 
 		 312 aa  58.9  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  35.71 
 
 		 681 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  32.69 
 
 		 262 aa  58.2  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1826  peptidase M23B  33.1 
 
 		 333 aa  58.2  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0261154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  38.18 
 
 		 621 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  43.01 
 
 		 524 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  35.37 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  36.94 
 
 		 491 aa  57.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  35.71 
 
 		 687 aa  57.4  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  36.69 
 
 		 468 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  35.71 
 
 		 695 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  37.96 
 
 		 299 aa  57  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0537  peptidase M23B  40.74 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.719073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  40.35 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  38.46 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  40.86 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  35.4 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  36.61 
 
 		 676 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.46 
 
 		 527 aa  56.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  37.5 
 
 		 690 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  40.18 
 
 		 651 aa  55.8  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  36.19 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  30 
 
 		 530 aa  55.8  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  38.98 
 
 		 695 aa  55.8  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  40.2 
 
 		 465 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  39.13 
 
 		 305 aa  55.5  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  40 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  38.21 
 
 		 651 aa  55.1  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  35.51 
 
 		 285 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  30.9 
 
 		 484 aa  55.5  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  38.21 
 
 		 651 aa  55.1  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  39.05 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  37.11 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  34.09 
 
 		 295 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  41.67 
 
 		 400 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  40.66 
 
 		 334 aa  55.1  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  34.85 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  29.63 
 
 		 534 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  39.58 
 
 		 404 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  36.36 
 
 		 475 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  31.94 
 
 		 453 aa  54.3  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  32.88 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2033  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  33.33 
 
 		 293 aa  54.3  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000771992  normal  0.476191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  30.71 
 
 		 307 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  33.33 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>