More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0038 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  80.61 
 
 		 592 aa  899    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  100 
 
 		 597 aa  1207    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  48.17 
 
 		 599 aa  490  1e-137  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  42.23 
 
 		 630 aa  438  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  34.93 
 
 		 571 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1247  Peptidase M23  31.46 
 
 		 791 aa  137  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0863  peptidase M23B  30.26 
 
 		 809 aa  128  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000213309  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  43.33 
 
 		 379 aa  89.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  40.57 
 
 		 274 aa  86.7  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  45 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4929  peptidase M23B  39.69 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.142258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  46.46 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  41.12 
 
 		 465 aa  84.3  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  47.92 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  42 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  44.95 
 
 		 276 aa  83.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2203  M24/M37 family peptidase  46.88 
 
 		 313 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  37.5 
 
 		 316 aa  83.2  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  38.39 
 
 		 268 aa  83.2  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  41.88 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  41.84 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4182  peptidase M23  38.93 
 
 		 306 aa  82.8  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  34.19 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  46.32 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  43.75 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  43.75 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  43.75 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1269  M24/M37 family peptidase  43.75 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.711589  hitchhiker  0.00022496 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  43.75 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2194  Peptidase M23  45.36 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000181252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  41.74 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  37.61 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  43.75 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  43.75 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  41 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  32.52 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  37.61 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  37.82 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  40.19 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  43 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  40.19 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  43 
 
 		 386 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  39.34 
 
 		 418 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  46.53 
 
 		 351 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0610  Peptidase M23  44.44 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  40.35 
 
 		 465 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0526  M24/M37 family peptidase  41 
 
 		 255 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0631  peptidase M23B  44.44 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  42.11 
 
 		 419 aa  79.7  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  41.67 
 
 		 293 aa  79.7  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  42.71 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  40 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04807  hypothetical protein  41.67 
 
 		 317 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  42 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  38.06 
 
 		 582 aa  79.3  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  42.71 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  42.71 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  39.02 
 
 		 418 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  34.93 
 
 		 491 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  36.96 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  42.71 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  41.67 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.46 
 
 		 321 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1590  Peptidase M23  44.57 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  38.68 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  42.42 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44 
 
 		 455 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  39.29 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  38.68 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  45.1 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  37.68 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  32.21 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  37.68 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  44.55 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  40.5 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  40.16 
 
 		 541 aa  77.8  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  44 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4531  Peptidase M23  42.73 
 
 		 137 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.45926 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.25 
 
 		 321 aa  77.4  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  37.04 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  38.84 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  42.86 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  41.67 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  37.68 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  37 
 
 		 244 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  27.81 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  38.94 
 
 		 464 aa  77.4  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  45.37 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  44.66 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1516  peptidase M23B  42 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  42.42 
 
 		 464 aa  77  0.0000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1925  peptidase  37.19 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  46.23 
 
 		 615 aa  77  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0676  peptidase M23B  40.21 
 
 		 482 aa  77  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3512  peptidase M23B  42.37 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000873252  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  44.74 
 
 		 621 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  46.15 
 
 		 400 aa  76.6  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  39.66 
 
 		 375 aa  76.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  37 
 
 		 266 aa  77  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0838  M24/M37 family peptidase  42.53 
 
 		 269 aa  77  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0667187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>