65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1003 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  46.09 
 
 		 193 aa  117  6e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  44.83 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  41.77 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  44.35 
 
 		 214 aa  110  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  45.16 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  45.69 
 
 		 205 aa  106  1e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  42.5 
 
 		 161 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  42.5 
 
 		 161 aa  97.4  9e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  37.1 
 
 		 139 aa  96.3  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  38.89 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  40.83 
 
 		 161 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  38.66 
 
 		 162 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  37.9 
 
 		 191 aa  90.9  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  40.87 
 
 		 211 aa  90.1  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  38.19 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  36.84 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  36.36 
 
 		 219 aa  88.2  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  38.66 
 
 		 249 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  37.29 
 
 		 162 aa  87.8  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  41.44 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  40.91 
 
 		 203 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  41.59 
 
 		 177 aa  85.5  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.04 
 
 		 238 aa  81.6  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  37.6 
 
 		 174 aa  80.5  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  38.89 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  40.59 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  40.32 
 
 		 362 aa  77.8  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  35.09 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  36.59 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.73 
 
 		 271 aa  66.2  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  32.67 
 
 		 331 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  32.81 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  29.57 
 
 		 300 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  35 
 
 		 253 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  29.03 
 
 		 437 aa  48.5  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  33.33 
 
 		 448 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0490  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 266 aa  47.8  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0330087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  28.7 
 
 		 300 aa  47.8  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  31.43 
 
 		 279 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4454  peptidase M23B  31.43 
 
 		 254 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.329906  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  34.57 
 
 		 296 aa  45.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1370  M24/M37 family peptidase  31.43 
 
 		 273 aa  45.4  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0779116  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1249  M24/M37 family peptidase  30.63 
 
 		 244 aa  44.3  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.838418  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  26.71 
 
 		 262 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  27.68 
 
 		 491 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2737  Peptidase M23  32.38 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.225501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  30.71 
 
 		 326 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.13 
 
 		 300 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0602  peptidase, M23/M37 family  29.63 
 
 		 268 aa  42.4  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  27.88 
 
 		 471 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0912  Peptidase M23  32.32 
 
 		 276 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.677753 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  27.19 
 
 		 274 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1568  peptidase M23B  28.33 
 
 		 317 aa  41.6  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1955  peptidase M23B  28.97 
 
 		 293 aa  42  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.090565  normal  0.0651038 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  30.49 
 
 		 299 aa  41.6  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  39.39 
 
 		 387 aa  41.6  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4435  Peptidase M23  26.54 
 
 		 308 aa  41.2  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  27.72 
 
 		 445 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001076  tagE protein  31.17 
 
 		 317 aa  41.2  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.107425  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  32.35 
 
 		 541 aa  40.8  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0414  Peptidase M23  29.91 
 
 		 436 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0487693 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  28.81 
 
 		 278 aa  40.8  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  27.27 
 
 		 452 aa  40.8  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  26.27 
 
 		 282 aa  40.4  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>