More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1859 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  100 
 
 
223 aa  428  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  62.5 
 
 
174 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  57.25 
 
 
214 aa  137  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  58.65 
 
 
164 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  58.65 
 
 
362 aa  131  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  45.88 
 
 
191 aa  128  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  49.26 
 
 
193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  55.3 
 
 
211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  54.89 
 
 
139 aa  119  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  50.31 
 
 
219 aa  118  7e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  52.86 
 
 
174 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  53.23 
 
 
254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  41.04 
 
 
269 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  45.97 
 
 
173 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  52.14 
 
 
161 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  51.24 
 
 
291 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  52.14 
 
 
161 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  52.14 
 
 
161 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  50 
 
 
162 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  46.67 
 
 
238 aa  107  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  45.83 
 
 
162 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  46.76 
 
 
169 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  50.38 
 
 
175 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  46.62 
 
 
203 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  47.15 
 
 
331 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  37.14 
 
 
195 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  46.76 
 
 
249 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  54.62 
 
 
170 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  42.34 
 
 
193 aa  93.2  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  34.97 
 
 
205 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.5 
 
 
271 aa  89.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  40.65 
 
 
170 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  48.36 
 
 
177 aa  82.4  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  30.07 
 
 
274 aa  58.9  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  31.09 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2837  Peptidase M23  25.57 
 
 
285 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  30.06 
 
 
265 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4046  peptidase M23B  38.17 
 
 
453 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.42477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  35.24 
 
 
223 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  37.1 
 
 
446 aa  55.8  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.65 
 
 
286 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.11 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0304  hypothetical protein  27.64 
 
 
272 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  38.14 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  44.44 
 
 
498 aa  53.9  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  34.17 
 
 
446 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  35.48 
 
 
271 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.95 
 
 
321 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  28.68 
 
 
445 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  27.14 
 
 
285 aa  53.9  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1429  putative lipoprotein  28.25 
 
 
279 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000184738  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0038  peptidase M23B  33.15 
 
 
330 aa  53.1  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  35.04 
 
 
468 aa  53.5  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.61 
 
 
509 aa  53.1  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  29.66 
 
 
469 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  33.67 
 
 
533 aa  52.4  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  35.43 
 
 
314 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  36.63 
 
 
299 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  36.63 
 
 
299 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  36.63 
 
 
299 aa  52  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  36.63 
 
 
299 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  40.4 
 
 
251 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  31.38 
 
 
264 aa  52  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  37.76 
 
 
464 aa  52  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  33.9 
 
 
284 aa  52  0.000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  36.13 
 
 
465 aa  52  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  30.08 
 
 
320 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0887  hypothetical protein  27.97 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  28.81 
 
 
300 aa  51.2  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0061  lipoprotein NlpD  29.32 
 
 
311 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  34.95 
 
 
285 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  30.91 
 
 
247 aa  51.2  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  32.92 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  34.38 
 
 
323 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  50 
 
 
411 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  35.25 
 
 
447 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  28.15 
 
 
307 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  33.83 
 
 
610 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00362  peptidase  34.65 
 
 
279 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0922306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  34.85 
 
 
457 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  31.9 
 
 
491 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  37.96 
 
 
439 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0255  peptidase M23B  34.38 
 
 
305 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  40 
 
 
266 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  35.64 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  29.87 
 
 
249 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  35.64 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  31.03 
 
 
475 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  34.65 
 
 
299 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0015  Peptidase M23  29.57 
 
 
395 aa  50.1  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136901  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  35.64 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  39.8 
 
 
464 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1006  Peptidase M23  40 
 
 
270 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  30.16 
 
 
417 aa  50.1  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  39 
 
 
293 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1224  peptidase M23B  39.62 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0694814 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  35.64 
 
 
299 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  26.54 
 
 
404 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  32.89 
 
 
430 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  28.78 
 
 
494 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>