240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3582 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3582  peptidase M23B  100 
 
 		 291 aa  573  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1160  peptidase M23B  60.29 
 
 		 269 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.37426 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1314  peptidase M23B  58.09 
 
 		 164 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09880  metalloendopeptidase-like membrane protein  56.93 
 
 		 219 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1203  peptidase M23B  55.88 
 
 		 214 aa  136  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.609657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3992  Peptidase M23  56.15 
 
 		 175 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2508  Peptidase M23  48.75 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.744479  normal  0.326949 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1973  peptidase M23B  50.36 
 
 		 161 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.537655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3244  peptidase M23B  49.32 
 
 		 211 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.6882  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1992  peptidase M23B  50.36 
 
 		 161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2038  peptidase M23B  50.36 
 
 		 161 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.101119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0675  hypothetical protein  42.36 
 
 		 362 aa  115  6e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2208  peptidase M23B  48.91 
 
 		 162 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5912  Peptidase M23  50.44 
 
 		 331 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00345275  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2103  Peptidase M23  48.44 
 
 		 174 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29214  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12905  hypothetical protein  44.16 
 
 		 249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00765288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1383  Peptidase M23  47.37 
 
 		 193 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000013113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10110  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.81 
 
 		 238 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4134  peptidase M23B  44.53 
 
 		 162 aa  105  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.300034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1859  peptidase, M23/M37 family  51.09 
 
 		 223 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.986198  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1543  peptidase M23B  45.21 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1657  Peptidase M23  46.67 
 
 		 169 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1483  Peptidase M23  51.09 
 
 		 203 aa  103  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.22964  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1528  Peptidase M23  43.94 
 
 		 139 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0244521 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1366  peptidase M23B  42.31 
 
 		 173 aa  97.4  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0643294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0988  Peptidase M23  45.52 
 
 		 174 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  0.110335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3114  Peptidase M23  49.23 
 
 		 170 aa  95.1  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00153698  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0950  peptidase, M23 family  40.58 
 
 		 205 aa  94.7  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1179  Peptidase M23  41.79 
 
 		 193 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.949137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11180  metalloendopeptidase-like membrane protein  43.44 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00950153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0396  M23/M37 family membrane peptidase  39.84 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00347919  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1412  peptidase M23B  49.59 
 
 		 177 aa  82  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.21699 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1003  Peptidase M23  31.76 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.760596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  34.07 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  33.61 
 
 		 527 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  32.03 
 
 		 375 aa  53.5  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  30.5 
 
 		 321 aa  53.5  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0494  peptidase M23B  34.31 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000148053  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  34.72 
 
 		 666 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3563  peptidase M23B  32.77 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000153251  hitchhiker  0.0000000453788 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0393  peptidase M23B  32.77 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000111959  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3736  peptidase M23B  32.77 
 
 		 299 aa  52.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000766225  hitchhiker  0.000000231142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  32.56 
 
 		 421 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  25.85 
 
 		 455 aa  52.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4212  M24/M37 family peptidase  32.77 
 
 		 299 aa  52.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  32.56 
 
 		 424 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0434  Peptidase M23  34.31 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000575635  unclonable  0.00000000000255737 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0420  peptidase M23B  34.31 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0052215  unclonable  0.00000446989 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3111  peptidase M23B  36.36 
 
 		 225 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.324565  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  24.59 
 
 		 420 aa  52  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0409  peptidase M23B  34.31 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0408  peptidase M23B  34.31 
 
 		 299 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000502252  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  32.17 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  37.72 
 
 		 372 aa  50.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  32.28 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  29.47 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0445  Peptidase M23  31.67 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  35.29 
 
 		 419 aa  50.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.87 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  36.22 
 
 		 265 aa  49.7  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  32.32 
 
 		 402 aa  49.7  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0795  peptidase M23B  32.03 
 
 		 253 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  27.01 
 
 		 265 aa  49.3  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1314  cell wall endopeptidase  31.78 
 
 		 423 aa  49.3  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000373067  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1313  cell wall endopeptidase  31.78 
 
 		 423 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309784  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1339  M24/M37 family peptidase  31.78 
 
 		 417 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000501622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1449  M23/37 family peptidase  31.78 
 
 		 417 aa  48.9  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000128519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1523  peptidase, M23/M37 family  31.78 
 
 		 423 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.25649e-59 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  28.66 
 
 		 603 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  28.66 
 
 		 603 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  30.07 
 
 		 473 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0236  Peptidase M23  30.83 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.668099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0074  peptidase M23B  34.17 
 
 		 513 aa  48.9  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  28.21 
 
 		 418 aa  48.5  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  30.85 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  34.35 
 
 		 391 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  29.37 
 
 		 475 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1554  M24/M37 family peptidase  35.48 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000152765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1354  peptidase M23B  35.48 
 
 		 424 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000810467  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  30.97 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  32.06 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2382  Peptidase M23  32.14 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1592  peptidase, M23/M37 family  35.48 
 
 		 423 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000620859  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  29.37 
 
 		 473 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  32.35 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  29.37 
 
 		 472 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  27.97 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  31.36 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  33.59 
 
 		 392 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  31.73 
 
 		 373 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  32.77 
 
 		 524 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 268 aa  47  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  32.35 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  26.98 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.61 
 
 		 425 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  36.13 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  31.71 
 
 		 313 aa  47.4  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0856  hypothetical protein  31.72 
 
 		 300 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  33.63 
 
 		 468 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  31.43 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>