More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1065 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1065  peptidase M23B  100 
 
 		 373 aa  729    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0161444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1793  peptidase M23B  49.34 
 
 		 426 aa  301  1e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.532041  normal  0.0360441 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  48.82 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1203  peptidase M23B  48.04 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.104562 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2543  peptidoglycan-binding LysM ( peptidase)  47.33 
 
 		 399 aa  279  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.97237  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1979  peptidase M23B  46.57 
 
 		 409 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.552283  normal  0.0521861 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2729  peptidase M23B  41.52 
 
 		 389 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.8886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  36.48 
 
 		 394 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  28.96 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  31.25 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  28.1 
 
 		 328 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  32.91 
 
 		 230 aa  96.3  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  30.68 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0899  peptidase M23B  33.63 
 
 		 240 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0792  peptidase M23B  29.61 
 
 		 257 aa  94.4  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.814248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  28.44 
 
 		 250 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0803  lipoprotein NlpD, putative  34.51 
 
 		 233 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  29.46 
 
 		 534 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0602  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  34.51 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469429  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1711  peptidase  34.51 
 
 		 296 aa  93.2  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.651895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1320  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  34.51 
 
 		 233 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1542  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  34.51 
 
 		 233 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0553  putative peptidoglycan-binding LysM/M23B peptidase  34.51 
 
 		 233 aa  93.6  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  29 
 
 		 251 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  29 
 
 		 251 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  29 
 
 		 251 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  29 
 
 		 251 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  32.74 
 
 		 268 aa  91.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  29 
 
 		 251 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  32.08 
 
 		 284 aa  90.1  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2752  lipoprotein NlpD, putative  34.53 
 
 		 295 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.112943  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  28.57 
 
 		 530 aa  90.5  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  31.84 
 
 		 412 aa  90.1  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1511  peptidase  33.33 
 
 		 236 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  32.31 
 
 		 230 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5969  Peptidase M23  33.04 
 
 		 261 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  34.89 
 
 		 484 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  30.27 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  44.26 
 
 		 494 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  31.38 
 
 		 261 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  30.74 
 
 		 315 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  31.56 
 
 		 274 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  28.76 
 
 		 251 aa  87  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  28.76 
 
 		 251 aa  86.7  6e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  28.76 
 
 		 251 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  45.61 
 
 		 501 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  32.44 
 
 		 275 aa  86.7  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1244  peptidase M23B  32.07 
 
 		 286 aa  86.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.309455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  45.61 
 
 		 537 aa  86.3  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  28.14 
 
 		 250 aa  86.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  29.44 
 
 		 250 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  29.44 
 
 		 250 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  29.44 
 
 		 250 aa  86.3  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  45.13 
 
 		 446 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  34.97 
 
 		 465 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  27.56 
 
 		 283 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  29 
 
 		 250 aa  85.5  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  30.04 
 
 		 295 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  31.36 
 
 		 427 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1296  peptidoglycan-binding LysM/peptidase M23B  31.11 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.775372  normal  0.108769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  32.18 
 
 		 264 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  31.36 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2205  putative lipoprotein  29.6 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.572382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  31.3 
 
 		 478 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  23.71 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  28.53 
 
 		 538 aa  83.6  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  40.68 
 
 		 474 aa  83.2  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  30.49 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  30.9 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  27.9 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  30.9 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  31.01 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  44.25 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  44.25 
 
 		 451 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  30.9 
 
 		 292 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4720  peptidase M23B  32.22 
 
 		 248 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.887961  normal  0.0183051 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  34.06 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  32.19 
 
 		 292 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  30.9 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  31.95 
 
 		 311 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  30.9 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  30.9 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  30.9 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  29.18 
 
 		 284 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  29.06 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  29.57 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  29.13 
 
 		 230 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  29.55 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  29.07 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  28.7 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  28.95 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  32.46 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  39.83 
 
 		 449 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  32.31 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  32.31 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  31.86 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  23.3 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  27.34 
 
 		 397 aa  79.7  0.00000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4600  peptidase M23B  30.38 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  25.99 
 
 		 509 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>