More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0906 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0906  Peptidase M23  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2544  Peptidase M23  66.67 
 
 
253 aa  355  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000189483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3162  peptidase M23B  47.71 
 
 
247 aa  239  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0922553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4539  stage IV sporulation protein FA  47.89 
 
 
248 aa  239  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.825176  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4181  stage IV sporulation protein FA  48.24 
 
 
248 aa  236  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4581  stage IV sporulation protein FA  47.13 
 
 
248 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000148961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4192  stage IV sporulation protein FA  47.84 
 
 
248 aa  236  3e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4566  stage IV sporulation protein FA  45.66 
 
 
248 aa  236  4e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0062532  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0668  stage IV sporulation protein FA  46.67 
 
 
248 aa  235  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00590074  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4345  stage IV sporulation protein FA  48.05 
 
 
248 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4527  stage IV sporulation protein FA  48.05 
 
 
248 aa  234  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4679  stage IV sporulation protein FA  48.05 
 
 
248 aa  234  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0885791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4293  peptidase M23B  48.05 
 
 
248 aa  234  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.911388  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  31.71 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  33.88 
 
 
501 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  35.14 
 
 
537 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  33.91 
 
 
494 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3330  Peptidase M23  30.3 
 
 
256 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0172603  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  23.7 
 
 
304 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  32.17 
 
 
538 aa  63.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  29.66 
 
 
484 aa  63.2  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  32.48 
 
 
412 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  29.45 
 
 
500 aa  62  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  30.43 
 
 
417 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0355  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.77 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.212949  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  30.77 
 
 
509 aa  59.7  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  28.7 
 
 
534 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0059  M24/M37 family peptidase  28.1 
 
 
190 aa  58.9  0.00000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.447213  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  30.08 
 
 
472 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  30.08 
 
 
472 aa  58.9  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  30.63 
 
 
446 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  28.7 
 
 
530 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  31.39 
 
 
455 aa  58.2  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  29.73 
 
 
451 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  29.73 
 
 
455 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2138  hypothetical protein  27.27 
 
 
409 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.123403  normal  0.331255 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  28.39 
 
 
454 aa  57  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  36.21 
 
 
382 aa  56.6  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  30.69 
 
 
425 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  31.78 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  30.69 
 
 
425 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  25.56 
 
 
471 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  32.99 
 
 
388 aa  56.2  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  29.84 
 
 
293 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  34.78 
 
 
405 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  30.69 
 
 
412 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  30.61 
 
 
271 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  26.05 
 
 
464 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  25.21 
 
 
449 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  29.7 
 
 
421 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1192  peptidase M23B  28.69 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  29.7 
 
 
400 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  29.7 
 
 
421 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  26.05 
 
 
453 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  29.7 
 
 
420 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  28.45 
 
 
310 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  30.6 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  31.09 
 
 
610 aa  54.3  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4956  Peptidase M23  33.62 
 
 
325 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.388458  normal  0.0405344 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  24.06 
 
 
478 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  26.35 
 
 
457 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  28.47 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  30.25 
 
 
447 aa  53.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  23.53 
 
 
474 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  29.86 
 
 
605 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1202  peptidase M23B  31.45 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  29.52 
 
 
440 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03726  hypothetical lipoprotein NlpD  30.17 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  29.52 
 
 
437 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  29.52 
 
 
440 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  30.17 
 
 
405 aa  53.1  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2225  lipoprotein NlpD, putative  29.66 
 
 
292 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  27.87 
 
 
284 aa  52.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1694  putative lipoprotein nlpD  33.62 
 
 
329 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.807801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  27.95 
 
 
381 aa  52.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0655  peptidase M23B  26.12 
 
 
201 aa  52.4  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  33.62 
 
 
438 aa  52.4  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  30.19 
 
 
446 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  29.23 
 
 
231 aa  52.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  29.93 
 
 
284 aa  52.4  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  29.27 
 
 
319 aa  52.4  0.000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1228  peptidase M23  31.45 
 
 
230 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  26.79 
 
 
457 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  26.79 
 
 
457 aa  52.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  31.96 
 
 
735 aa  52.4  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  31 
 
 
305 aa  52.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.06 
 
 
387 aa  52.4  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  30.1 
 
 
429 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1947  Peptidase M23  25.78 
 
 
221 aa  52.4  0.000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.653444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  33.7 
 
 
294 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  28.91 
 
 
274 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  33.61 
 
 
240 aa  52.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  35.9 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  27.78 
 
 
282 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  31.58 
 
 
370 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3262  peptidase M23B  30.51 
 
 
331 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.803943  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0273  peptidase M23  28.17 
 
 
285 aa  51.6  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  30.63 
 
 
295 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  33.33 
 
 
293 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  28.81 
 
 
292 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>