More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0575 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  100 
 
 		 405 aa  763    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  42.93 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  44.15 
 
 		 413 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  29.52 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  28.72 
 
 		 461 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  28.21 
 
 		 469 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  29.53 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  27.78 
 
 		 471 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  29.98 
 
 		 455 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  27.85 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  29.25 
 
 		 440 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  28.5 
 
 		 450 aa  103  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  25.91 
 
 		 445 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  28.95 
 
 		 446 aa  102  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  28.57 
 
 		 477 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  31.17 
 
 		 466 aa  99  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  29.25 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  31.17 
 
 		 466 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  31.97 
 
 		 401 aa  98.6  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  29.77 
 
 		 458 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  28.85 
 
 		 465 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  41.4 
 
 		 491 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  27.18 
 
 		 467 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  27.96 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  28.49 
 
 		 423 aa  92.8  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  38.1 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  25.25 
 
 		 457 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  27.34 
 
 		 478 aa  83.6  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  40.31 
 
 		 387 aa  83.2  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  27.81 
 
 		 363 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  25.78 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  42.37 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  42.37 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  27.52 
 
 		 366 aa  81.3  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  44.55 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  40.34 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  36.84 
 
 		 377 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  25.27 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  37.5 
 
 		 378 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  40.68 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  35.65 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 382 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  33.58 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  26.18 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  39.67 
 
 		 392 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  26.51 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  40 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  37.82 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  39.13 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  30.13 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  36.67 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  36.13 
 
 		 444 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  39.13 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  39.13 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  41.07 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  33.93 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  34.93 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  34.82 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  34.93 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  31.9 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.83 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  35.4 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  26.72 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  26.99 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  33.86 
 
 		 370 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  33.86 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  36.44 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  37.72 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  37.39 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  24.86 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  37.39 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  36.52 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  36.84 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  29.45 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  35.4 
 
 		 377 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  32.5 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  35.9 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  36.75 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  36.52 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  37.38 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  33.07 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  36.72 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  31.97 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  26.11 
 
 		 449 aa  69.3  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  25.5 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  32.46 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  25.5 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  32.81 
 
 		 424 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  33.56 
 
 		 411 aa  69.7  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  36.44 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  35.29 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  22.56 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  33.06 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  23.32 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  33.61 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  32.19 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  27.81 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  33.61 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  33.61 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  36.13 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>