More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4222 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  89.43 
 
 		 440 aa  670    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  100 
 
 		 430 aa  824    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  63.49 
 
 		 466 aa  520  1e-146  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  63.27 
 
 		 466 aa  518  1e-146  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  62.11 
 
 		 458 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  61.24 
 
 		 455 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  50.34 
 
 		 459 aa  378  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  50.23 
 
 		 457 aa  366  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  46.15 
 
 		 448 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  47.73 
 
 		 463 aa  336  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  48.74 
 
 		 445 aa  331  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  46.05 
 
 		 477 aa  332  1e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  46.6 
 
 		 471 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  45.84 
 
 		 461 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  46.19 
 
 		 469 aa  325  1e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  44.06 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  40.7 
 
 		 440 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  41.85 
 
 		 478 aa  292  9e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  41.97 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  39.32 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  41.5 
 
 		 423 aa  283  5.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  40.4 
 
 		 449 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  40.15 
 
 		 449 aa  278  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  40.39 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  39.74 
 
 		 446 aa  219  8.999999999999998e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  30.69 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  33.81 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  33.03 
 
 		 350 aa  129  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  46.27 
 
 		 491 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  30.19 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  29.34 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  28.88 
 
 		 367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  29.92 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  31.95 
 
 		 367 aa  106  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  31.62 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  31.94 
 
 		 413 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  28.66 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  26.7 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.59 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  40.15 
 
 		 392 aa  97.4  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  26.93 
 
 		 388 aa  93.6  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  25.61 
 
 		 411 aa  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  28.65 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  35.17 
 
 		 387 aa  89  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  29.57 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  29.72 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  20.83 
 
 		 374 aa  86.7  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  36.3 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  36.3 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  35.76 
 
 		 370 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.24 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  35.82 
 
 		 477 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  25.88 
 
 		 366 aa  82.8  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  24.94 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  23.4 
 
 		 379 aa  80.9  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  31.03 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  32.59 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  33.53 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  25.26 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  23.63 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  33.53 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  33.53 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.7 
 
 		 428 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  24.02 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  32.57 
 
 		 381 aa  74.3  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  29.63 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  33.86 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  33.86 
 
 		 436 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  26.18 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  30.71 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  26.16 
 
 		 396 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  26.18 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  28.89 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  29.13 
 
 		 375 aa  72  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  26.18 
 
 		 456 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  31.62 
 
 		 417 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  31.62 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  29.2 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  30.65 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  31.62 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  31.62 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  30.66 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  28.64 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  29.93 
 
 		 440 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  19.81 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  32.43 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  30.88 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  27.12 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  35.33 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  28.15 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.56 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3433  lipoprotein NlpD  36.59 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  29.2 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  30.43 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  28.44 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  21.98 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  36.59 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  36.59 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  32.14 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>