76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2756 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  100 
 
 		 367 aa  711    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  50.57 
 
 		 370 aa  299  7e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  50.86 
 
 		 370 aa  298  8e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  49.16 
 
 		 370 aa  292  6e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  47.5 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  46.06 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  45.95 
 
 		 367 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  27.07 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  26.78 
 
 		 466 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  26.78 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  28.57 
 
 		 430 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  27.88 
 
 		 448 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  30 
 
 		 401 aa  115  8.999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  28.03 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  26.06 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  26.39 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  27.18 
 
 		 471 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  27.1 
 
 		 423 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  26.26 
 
 		 461 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  27.27 
 
 		 463 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  25.6 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  26.55 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  26.96 
 
 		 491 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  26.39 
 
 		 446 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  28.39 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  24.01 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  26.47 
 
 		 449 aa  97.8  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  26.47 
 
 		 449 aa  98.2  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  27.18 
 
 		 477 aa  90.9  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  35.81 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  32.39 
 
 		 455 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  34.51 
 
 		 459 aa  88.6  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  32.14 
 
 		 467 aa  81.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  31.51 
 
 		 465 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  32.68 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  31.69 
 
 		 457 aa  75.1  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  24.6 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.36 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  29.05 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  22.22 
 
 		 369 aa  59.7  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  25.48 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  31.5 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  27.01 
 
 		 392 aa  52.8  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  24.09 
 
 		 455 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  22.55 
 
 		 412 aa  52.4  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  26.85 
 
 		 398 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  25.38 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  22.22 
 
 		 366 aa  51.2  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  27.34 
 
 		 413 aa  50.1  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  20.55 
 
 		 426 aa  50.1  0.00007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  28.76 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  18.86 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  28.76 
 
 		 438 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  28.76 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  27.63 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 382 aa  48.5  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.57 
 
 		 382 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  26.62 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  26.53 
 
 		 430 aa  46.6  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  30.67 
 
 		 405 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.31 
 
 		 394 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  27.1 
 
 		 382 aa  46.2  0.0009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  25.81 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  23.49 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  22.88 
 
 		 417 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  23.65 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  24.09 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  23.49 
 
 		 441 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  25.5 
 
 		 416 aa  43.1  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  20.45 
 
 		 411 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  25 
 
 		 397 aa  43.1  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  26.53 
 
 		 373 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  25.83 
 
 		 477 aa  43.1  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.39 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  24.64 
 
 		 427 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  26.53 
 
 		 372 aa  42.7  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>