More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0165 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  75.17 
 
 		 461 aa  655    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  100 
 
 		 448 aa  884    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  81.44 
 
 		 471 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  74.41 
 
 		 463 aa  651    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  75.98 
 
 		 469 aa  622  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  74.94 
 
 		 450 aa  620  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  74.94 
 
 		 445 aa  568  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  53 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  44.91 
 
 		 477 aa  361  1e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  48.86 
 
 		 457 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  45.59 
 
 		 458 aa  348  1e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  46.55 
 
 		 466 aa  343  4e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  46.55 
 
 		 466 aa  343  5e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  48.68 
 
 		 440 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  46.15 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  46.49 
 
 		 455 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  43.02 
 
 		 478 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  43.65 
 
 		 440 aa  300  2e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  42.53 
 
 		 423 aa  290  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  43.22 
 
 		 491 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  43.22 
 
 		 465 aa  282  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  42.26 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  42.26 
 
 		 449 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  43.22 
 
 		 467 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  35.05 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  39.9 
 
 		 446 aa  233  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  33.57 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  29.66 
 
 		 350 aa  130  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  42.55 
 
 		 491 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  29.27 
 
 		 370 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  27.88 
 
 		 367 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  29.09 
 
 		 370 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  27.37 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  26.1 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  30.29 
 
 		 414 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  26.29 
 
 		 367 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  27.2 
 
 		 386 aa  100  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  36.88 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  26.77 
 
 		 413 aa  97.8  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  23.99 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  22.49 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  24.05 
 
 		 404 aa  94.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  24.47 
 
 		 398 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  27.62 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.82 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.33 
 
 		 391 aa  90.1  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.4 
 
 		 397 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.86 
 
 		 430 aa  87.8  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  24.29 
 
 		 388 aa  87.4  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  29.5 
 
 		 405 aa  87.4  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  23.01 
 
 		 397 aa  87.4  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  23.5 
 
 		 420 aa  87  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  26.73 
 
 		 398 aa  86.7  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  27.44 
 
 		 387 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25.8 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  23.76 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  23.76 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  21.71 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  25.9 
 
 		 436 aa  80.9  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  29.88 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  27.68 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  25.96 
 
 		 436 aa  80.1  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  21.1 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  28.68 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  23.6 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  25.61 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  33.33 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  30.32 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  22.46 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  22.82 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  32.62 
 
 		 370 aa  77  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  23.42 
 
 		 441 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  23.3 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  21.91 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  31.21 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  27.24 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  32.62 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  32.62 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  24.68 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  25.06 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  23.87 
 
 		 378 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  25.36 
 
 		 378 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.08 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  22.71 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  24.45 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  22.51 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  23.02 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  22.59 
 
 		 366 aa  67.4  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  27.4 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  25.97 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  23.91 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  29.67 
 
 		 394 aa  64.3  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  23.2 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  28.68 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  24.44 
 
 		 374 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  24.71 
 
 		 455 aa  63.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  21.63 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  21.77 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  21.77 
 
 		 427 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>