More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3022 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  100 
 
 
449 aa  843    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  29.55 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  29.21 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  31.67 
 
 
455 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  34.02 
 
 
392 aa  111  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  28.54 
 
 
448 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  27.97 
 
 
459 aa  108  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  28.25 
 
 
471 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  29.14 
 
 
463 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  28.06 
 
 
461 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  28.01 
 
 
449 aa  102  9e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  26.98 
 
 
440 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  27.75 
 
 
449 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  30.24 
 
 
440 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  30.69 
 
 
466 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  30.69 
 
 
466 aa  101  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  28.22 
 
 
445 aa  100  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  30.79 
 
 
430 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  26.03 
 
 
423 aa  99  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  30.36 
 
 
458 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  26.94 
 
 
446 aa  97.1  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  29.89 
 
 
457 aa  95.5  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  26.53 
 
 
477 aa  95.5  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  27.23 
 
 
478 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  28.18 
 
 
465 aa  94.4  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  28.14 
 
 
467 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  42.34 
 
 
491 aa  90.1  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  29.95 
 
 
414 aa  89.7  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  27.95 
 
 
350 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  26.84 
 
 
491 aa  87.8  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  40.83 
 
 
401 aa  87  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  27.72 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.96 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.13 
 
 
397 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  25.87 
 
 
397 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  32.34 
 
 
413 aa  77  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  41.59 
 
 
405 aa  77  0.0000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  32.33 
 
 
420 aa  74.7  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  28.37 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  25 
 
 
396 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  23.39 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  20.84 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  36.07 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  35.1 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  31.33 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  31.33 
 
 
472 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  33.1 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  31.65 
 
 
411 aa  67  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  34.44 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  27.16 
 
 
402 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  27 
 
 
378 aa  65.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  36.23 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  34.44 
 
 
372 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  27.98 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  27.98 
 
 
436 aa  64.3  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  32.52 
 
 
370 aa  63.9  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  34.31 
 
 
370 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  22.9 
 
 
404 aa  63.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  32.2 
 
 
478 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.1 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  35.11 
 
 
370 aa  63.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  24.69 
 
 
377 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  25.84 
 
 
420 aa  63.2  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  31.36 
 
 
474 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  31.2 
 
 
432 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  34.75 
 
 
453 aa  62  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  23.55 
 
 
377 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  31.36 
 
 
464 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  33.87 
 
 
372 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  21.43 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  21.43 
 
 
377 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  23.28 
 
 
361 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  31.09 
 
 
481 aa  61.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  33.58 
 
 
370 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  22.73 
 
 
344 aa  60.5  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  32.52 
 
 
375 aa  60.5  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  28.99 
 
 
400 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  33.04 
 
 
484 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  23.97 
 
 
362 aa  60.1  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  23.02 
 
 
378 aa  60.1  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  23.97 
 
 
362 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  27.27 
 
 
398 aa  60.1  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  33.61 
 
 
405 aa  60.1  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  24.7 
 
 
367 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  31.9 
 
 
381 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  30.51 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  23.98 
 
 
362 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  23.98 
 
 
362 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  24.45 
 
 
456 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  31.09 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  31.36 
 
 
471 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  30.65 
 
 
301 aa  58.2  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  28.23 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  29.5 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.56 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  37.76 
 
 
450 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  24.18 
 
 
456 aa  57.4  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  24.18 
 
 
456 aa  57  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  29.9 
 
 
374 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  25.87 
 
 
424 aa  57  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>