More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1233 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  100 
 
 		 491 aa  951    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  29.88 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  29.79 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  30.17 
 
 		 450 aa  152  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  32.19 
 
 		 455 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  29.34 
 
 		 471 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  28.73 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  28.83 
 
 		 477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  27.81 
 
 		 461 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  29.61 
 
 		 459 aa  134  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  28.31 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  43.79 
 
 		 446 aa  131  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  31.12 
 
 		 449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  31.12 
 
 		 449 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  41.13 
 
 		 463 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  31.54 
 
 		 440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  26.07 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  26.91 
 
 		 467 aa  123  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  42.57 
 
 		 423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  46.27 
 
 		 430 aa  120  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  44.78 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  43.71 
 
 		 414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  28.87 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  39.05 
 
 		 457 aa  113  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  33.06 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  29.88 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  35.42 
 
 		 401 aa  110  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  40.52 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  40.52 
 
 		 466 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  36.43 
 
 		 478 aa  109  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  41.35 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  38.71 
 
 		 404 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  39.61 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  35.21 
 
 		 420 aa  107  4e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  28 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  37.11 
 
 		 477 aa  103  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  37.78 
 
 		 391 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  41.13 
 
 		 432 aa  99.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  34.59 
 
 		 412 aa  98.6  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  38.78 
 
 		 411 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  32.41 
 
 		 397 aa  97.1  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  38.36 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  34.25 
 
 		 394 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  35.11 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  39.33 
 
 		 372 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  36.99 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  38.36 
 
 		 436 aa  95.9  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  27.19 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  34.91 
 
 		 428 aa  94.7  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  34.35 
 
 		 397 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  26.13 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  40 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  40.13 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  36.8 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  36.8 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  31.2 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  36.8 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  36.8 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  39.47 
 
 		 372 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  33.1 
 
 		 387 aa  92.4  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  36.8 
 
 		 427 aa  91.7  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  29.57 
 
 		 428 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  26.13 
 
 		 438 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  38.82 
 
 		 370 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  37.59 
 
 		 405 aa  90.5  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  34.07 
 
 		 424 aa  90.1  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  26.58 
 
 		 438 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  34.27 
 
 		 366 aa  90.1  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  36 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  36 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  36 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  34.84 
 
 		 440 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  41.18 
 
 		 350 aa  89.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  36 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  36 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  36 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  36 
 
 		 427 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  36 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  36 
 
 		 419 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  35.2 
 
 		 427 aa  88.6  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  33.33 
 
 		 370 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  29.08 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  29.08 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  29.08 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  44.83 
 
 		 449 aa  87.8  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  35.43 
 
 		 375 aa  87.8  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  36.09 
 
 		 441 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  32.92 
 
 		 386 aa  86.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  35.29 
 
 		 363 aa  86.7  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  34.71 
 
 		 411 aa  86.3  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  35.2 
 
 		 382 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  39.42 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  32.9 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  33.86 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  35.43 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  32.05 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  37.59 
 
 		 420 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.01 
 
 		 455 aa  84.3  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  28.47 
 
 		 430 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  36.51 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>