More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3452 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  100 
 
 		 423 aa  833    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  49.16 
 
 		 449 aa  382  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  49.16 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  49.29 
 
 		 440 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  44.2 
 
 		 478 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  41.12 
 
 		 465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  44.5 
 
 		 450 aa  300  2e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  43.22 
 
 		 448 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  41.06 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  41.61 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  45.27 
 
 		 463 aa  296  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  41.12 
 
 		 491 aa  293  3e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  39.86 
 
 		 458 aa  292  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  43.09 
 
 		 469 aa  292  7e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  38.12 
 
 		 420 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  42.24 
 
 		 471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  39.8 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  44.08 
 
 		 440 aa  279  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  41.37 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  43.53 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  39.86 
 
 		 466 aa  277  2e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  39.86 
 
 		 466 aa  277  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  41.81 
 
 		 461 aa  275  8e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  39.43 
 
 		 477 aa  272  1e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  43.84 
 
 		 445 aa  271  2e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  35.82 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  32.74 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  32.71 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  42.57 
 
 		 491 aa  120  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  29.19 
 
 		 386 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  30.48 
 
 		 367 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  27.5 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  29.95 
 
 		 370 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  28.41 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  29.3 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  26.21 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  27.1 
 
 		 367 aa  106  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  27.48 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  30.23 
 
 		 414 aa  104  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  40.16 
 
 		 392 aa  96.7  7e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  25.07 
 
 		 412 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  35.14 
 
 		 373 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  35.42 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  35.14 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  25.53 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  35.04 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  36.11 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  34.09 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  30.73 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  35.04 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  26.3 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  35.06 
 
 		 405 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  26.19 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  24.69 
 
 		 430 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  24.85 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  40.5 
 
 		 449 aa  79.7  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  22.52 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  33.77 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  24.33 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  23.22 
 
 		 397 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  28.44 
 
 		 424 aa  76.3  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  26.79 
 
 		 381 aa  75.1  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  22.22 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  22.22 
 
 		 456 aa  75.1  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  22.22 
 
 		 456 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  21.8 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  23.89 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  29.1 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  23.68 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  23.43 
 
 		 378 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 382 aa  74.3  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  30.88 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  25.16 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  21.5 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  33.33 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  25.22 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  28.76 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  33.33 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  22.27 
 
 		 433 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  22.26 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  26.43 
 
 		 416 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  32.37 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  25.23 
 
 		 369 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  32.61 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.31 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  22.82 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  28.16 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  22.82 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.08 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  32 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  32.12 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  31.28 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  25.06 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  22.82 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  25.87 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  32.35 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  22.82 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  22.82 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  29.93 
 
 		 428 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  22.82 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>