More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1473 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  100 
 
 		 446 aa  869    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  38.98 
 
 		 471 aa  256  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  39.23 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  38.34 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  38.5 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  38.01 
 
 		 450 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  37.85 
 
 		 469 aa  248  2e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  36.32 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  35.89 
 
 		 477 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  37.78 
 
 		 445 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  38.37 
 
 		 478 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  37.22 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  38.28 
 
 		 465 aa  233  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  35.16 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  37.82 
 
 		 430 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  37.82 
 
 		 440 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  36.93 
 
 		 458 aa  223  6e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  35.64 
 
 		 449 aa  222  9e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  35.64 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  37.89 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  35.12 
 
 		 440 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  37.89 
 
 		 466 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  37.47 
 
 		 455 aa  219  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  37.32 
 
 		 467 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  33.01 
 
 		 491 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  37.03 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  28.94 
 
 		 420 aa  187  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  29.67 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  41.4 
 
 		 491 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  26.79 
 
 		 370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  28.71 
 
 		 414 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  28.1 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  27.65 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  28.45 
 
 		 386 aa  113  5e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  27.98 
 
 		 367 aa  106  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  29.2 
 
 		 413 aa  103  7e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  29.03 
 
 		 405 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  26.79 
 
 		 449 aa  98.6  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  24.83 
 
 		 411 aa  98.2  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  27.67 
 
 		 367 aa  90.1  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  24.75 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  25.35 
 
 		 398 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  30.56 
 
 		 370 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  31.55 
 
 		 373 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  31.55 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  23.8 
 
 		 412 aa  83.2  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  30.36 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  30.18 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  35.29 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  23.31 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  25 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  26.07 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  25.71 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  19.17 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  27.34 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  29.66 
 
 		 405 aa  75.1  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  28.49 
 
 		 477 aa  74.7  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.65 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  26.7 
 
 		 481 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  24.92 
 
 		 396 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  24.21 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  18.93 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  25.74 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.26 
 
 		 387 aa  72.4  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  24.54 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  25.99 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  22.86 
 
 		 413 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  25.99 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  24.31 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  25.81 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  24.07 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  25.99 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  26.87 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  28.93 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  22.62 
 
 		 369 aa  69.7  0.00000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  30.14 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  28.4 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  23.85 
 
 		 377 aa  67  0.0000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  25.06 
 
 		 438 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  26.67 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  26.67 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  26.34 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  26.06 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  26.67 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  22.85 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  27.59 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.71 
 
 		 440 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.7 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.1 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  25.45 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  25.45 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  25.45 
 
 		 427 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  25.45 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  25.45 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  25.45 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>