222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0090 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  100 
 
 		 367 aa  688    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  50 
 
 		 370 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  48.32 
 
 		 386 aa  280  4e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  50.29 
 
 		 370 aa  279  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  49.71 
 
 		 370 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  45.83 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  43.77 
 
 		 411 aa  255  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  30.48 
 
 		 423 aa  124  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  31.18 
 
 		 440 aa  123  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  30.03 
 
 		 491 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  26.13 
 
 		 465 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  27.39 
 
 		 467 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  29.84 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  29.84 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  29.97 
 
 		 458 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  27.8 
 
 		 455 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  32.52 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  29.21 
 
 		 430 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  29.19 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  26 
 
 		 448 aa  106  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  29.57 
 
 		 440 aa  106  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  27.55 
 
 		 463 aa  106  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  25.3 
 
 		 478 aa  106  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  29.4 
 
 		 459 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  28.35 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  27.24 
 
 		 445 aa  100  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  27.3 
 
 		 471 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  25.39 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  28.25 
 
 		 477 aa  99  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  26.99 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  25.39 
 
 		 449 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  36.55 
 
 		 457 aa  98.2  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  28.7 
 
 		 401 aa  89.7  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  22.29 
 
 		 374 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  22.56 
 
 		 420 aa  87  5e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  23.91 
 
 		 411 aa  85.1  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  29.81 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  23.76 
 
 		 387 aa  82  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 382 aa  82.4  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  25.2 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  28.53 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  30.2 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  24.13 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  31.87 
 
 		 491 aa  73.6  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  28.19 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  33.12 
 
 		 405 aa  72  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  25.52 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  20.63 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  33.54 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  20.63 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  30.94 
 
 		 412 aa  69.3  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  30.26 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.29 
 
 		 441 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  24.51 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  24.51 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  24.51 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  28.33 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  24.51 
 
 		 362 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  30 
 
 		 405 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  27.31 
 
 		 398 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  34.29 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  34.29 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  31.39 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  26.04 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  31.16 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  30.43 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  28.77 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  23.78 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  22.58 
 
 		 388 aa  63.5  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  37.62 
 
 		 449 aa  63.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  32.54 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  30.82 
 
 		 472 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  30.82 
 
 		 472 aa  62.8  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  30.34 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  22.9 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  24.42 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  24.42 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  29.77 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  27.8 
 
 		 424 aa  62  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  24.26 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  26.64 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  29.93 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  24.03 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  23.64 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  23.81 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  29.2 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  28.67 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  29.2 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  31.21 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  25.94 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  33.83 
 
 		 374 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  29.2 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  26.58 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  32.06 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  31.3 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  23.46 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.34 
 
 		 394 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  22.44 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  23.08 
 
 		 377 aa  55.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>