More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2288 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  99.57 
 
 		 466 aa  904    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  100 
 
 		 466 aa  907    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  94.65 
 
 		 458 aa  801    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  69.51 
 
 		 455 aa  590  1e-167  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  65.57 
 
 		 440 aa  499  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  63.04 
 
 		 430 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  49.23 
 
 		 459 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  50.33 
 
 		 457 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  50.77 
 
 		 463 aa  353  5e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  50.26 
 
 		 461 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  46.33 
 
 		 448 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  49.23 
 
 		 471 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  46.62 
 
 		 445 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  43.25 
 
 		 469 aa  331  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  42.23 
 
 		 450 aa  319  7.999999999999999e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  43.88 
 
 		 477 aa  304  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  38.52 
 
 		 440 aa  297  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  40.43 
 
 		 465 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  39.31 
 
 		 449 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  39.07 
 
 		 449 aa  282  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  40.9 
 
 		 478 aa  278  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  39.62 
 
 		 467 aa  276  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  40.87 
 
 		 491 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  39.86 
 
 		 423 aa  276  5e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  38.5 
 
 		 446 aa  205  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  31.19 
 
 		 420 aa  204  4e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  35.37 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  30.52 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  30.08 
 
 		 370 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  26.78 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  30.68 
 
 		 370 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  29.73 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  40.52 
 
 		 491 aa  110  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  27.68 
 
 		 386 aa  110  5e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  30 
 
 		 367 aa  108  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  30.34 
 
 		 413 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  28.06 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  28.61 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  39.04 
 
 		 392 aa  93.2  8e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  24.94 
 
 		 412 aa  89.4  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  25.32 
 
 		 477 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  29.38 
 
 		 405 aa  83.2  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  31.51 
 
 		 405 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.05 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  34.68 
 
 		 481 aa  81.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.89 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  27.51 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  32.88 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  23.9 
 
 		 379 aa  79.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  27.09 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.59 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  33.11 
 
 		 388 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  22.73 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  25.86 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  24.51 
 
 		 413 aa  75.1  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  24.23 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  24.27 
 
 		 369 aa  74.7  0.000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  21.83 
 
 		 397 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  22.08 
 
 		 424 aa  72.8  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.83 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  23.59 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  21.57 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  34.44 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  24.62 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  35.1 
 
 		 373 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  29.66 
 
 		 381 aa  70.1  0.00000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  31.45 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  27.59 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  35.1 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  25.06 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  24.32 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  23.13 
 
 		 456 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  24.77 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  24.62 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  25.28 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  23.41 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  28.46 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  22.51 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.13 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  22.91 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  34.62 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  24.48 
 
 		 416 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  19.83 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  33.11 
 
 		 370 aa  67  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  31.03 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  26.5 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  19.39 
 
 		 399 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  27.4 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  21.35 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  27.4 
 
 		 366 aa  63.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  24.94 
 
 		 428 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  28.46 
 
 		 430 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  22.6 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  29.25 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  27.51 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  29.02 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  29.02 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  22.73 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  35.34 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>