More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0644 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  100 
 
 		 457 aa  896    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  65.03 
 
 		 459 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  50.56 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  50.33 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  49.45 
 
 		 458 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  48.63 
 
 		 448 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  54.01 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  51.23 
 
 		 455 aa  380  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  52.97 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  49.51 
 
 		 463 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  48.53 
 
 		 469 aa  372  1e-102  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  46.71 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  46.5 
 
 		 471 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  47.89 
 
 		 461 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  49.35 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  42.31 
 
 		 477 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  42.04 
 
 		 478 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  41.37 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  39.86 
 
 		 491 aa  291  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  39.03 
 
 		 440 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  40.15 
 
 		 465 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  41.36 
 
 		 467 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  41.38 
 
 		 449 aa  276  7e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  41.11 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  37.53 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  30.65 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  30.13 
 
 		 401 aa  157  5.0000000000000005e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  29.41 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  39.26 
 
 		 491 aa  117  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  32.32 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  27.37 
 
 		 370 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  27.58 
 
 		 370 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  28.08 
 
 		 413 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  29.08 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  26.83 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  25.79 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  26.26 
 
 		 370 aa  97.4  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  25.91 
 
 		 456 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  25.68 
 
 		 456 aa  97.1  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  25.91 
 
 		 456 aa  97.1  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  26.5 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  23.88 
 
 		 424 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  23.17 
 
 		 433 aa  90.1  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  25.71 
 
 		 416 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  25.59 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  27.49 
 
 		 436 aa  87.8  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  26.97 
 
 		 387 aa  86.7  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  27.56 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  28.85 
 
 		 449 aa  85.5  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  22.63 
 
 		 387 aa  84  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  23.94 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.97 
 
 		 388 aa  80.9  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  28.97 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  24.65 
 
 		 412 aa  80.9  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  22.97 
 
 		 428 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  24.81 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  33.1 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  35.11 
 
 		 392 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  24.81 
 
 		 369 aa  79  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  23.33 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  20.57 
 
 		 374 aa  77  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.28 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  33.14 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  22.54 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  26.06 
 
 		 405 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  34 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  27.4 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  27.95 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  21.32 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  28.87 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  22.12 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  23.02 
 
 		 440 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  33.8 
 
 		 373 aa  71.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  33.82 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  24.38 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  26.28 
 
 		 381 aa  70.9  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  33.8 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  33.1 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  21.45 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  26.08 
 
 		 432 aa  69.7  0.00000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  24.32 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  22.56 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25.18 
 
 		 428 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  27.68 
 
 		 381 aa  67.8  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  24.32 
 
 		 438 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  22.01 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  21.23 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  32.65 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  22.3 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  24.46 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  21.62 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  22.75 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  20.26 
 
 		 379 aa  65.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  22.17 
 
 		 387 aa  65.1  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  22.07 
 
 		 377 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  21.01 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  21.01 
 
 		 419 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  29.21 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  29.21 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>