265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0904 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  100 
 
 
392 aa  740    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  37.17 
 
 
449 aa  159  8e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  28.9 
 
 
469 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  28.13 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  27.58 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  31.03 
 
 
466 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  29.74 
 
 
466 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  31.3 
 
 
440 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  30.14 
 
 
430 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  29.51 
 
 
455 aa  108  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  26.63 
 
 
423 aa  106  7e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  36.81 
 
 
461 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  26.25 
 
 
448 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  29.95 
 
 
458 aa  103  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  36.81 
 
 
471 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  36.11 
 
 
463 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  29.52 
 
 
465 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  42.03 
 
 
467 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  35.45 
 
 
440 aa  99.4  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  27.19 
 
 
478 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  27.83 
 
 
459 aa  95.5  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  39.84 
 
 
449 aa  94  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  39.84 
 
 
449 aa  93.6  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  32.82 
 
 
414 aa  93.6  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  31.65 
 
 
477 aa  92.8  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  24.19 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  38.35 
 
 
350 aa  86.7  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  28.03 
 
 
491 aa  85.9  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  42.74 
 
 
491 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  35.29 
 
 
446 aa  83.6  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  34.72 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  39.2 
 
 
401 aa  81.6  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  39.67 
 
 
405 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  26.3 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  38.26 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  36.75 
 
 
481 aa  71.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  28 
 
 
394 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  27.73 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  33.08 
 
 
398 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  30.59 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  32.33 
 
 
411 aa  65.5  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  27.55 
 
 
386 aa  64.3  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  35.59 
 
 
381 aa  63.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  34.75 
 
 
477 aa  63.5  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  26.5 
 
 
378 aa  63.5  0.000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  33.33 
 
 
426 aa  63.2  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  25.42 
 
 
387 aa  63.2  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  33.61 
 
 
436 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  31.4 
 
 
411 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  34.43 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  33.61 
 
 
436 aa  62.4  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  25.31 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  31.65 
 
 
370 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  24.6 
 
 
397 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  32 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  31.97 
 
 
432 aa  60.8  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2141  peptidase M23B  41.25 
 
 
649 aa  60.8  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.506727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  34.43 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  60.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  25.36 
 
 
367 aa  60.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  34.15 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  33.61 
 
 
362 aa  60.1  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.45 
 
 
391 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  33.06 
 
 
377 aa  59.7  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  33.61 
 
 
428 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  33.61 
 
 
362 aa  59.7  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  33.61 
 
 
362 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  33.61 
 
 
344 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  33.61 
 
 
362 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  32.82 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  32.82 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  32.82 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  32.82 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  30.94 
 
 
370 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  32.82 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  32.82 
 
 
419 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  32.82 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  32.54 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  32.82 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  29.75 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  31.3 
 
 
427 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  31.3 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  33.61 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  32.82 
 
 
427 aa  58.2  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  33.61 
 
 
377 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  24.68 
 
 
411 aa  57.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  33.87 
 
 
314 aa  57.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  31.97 
 
 
361 aa  57.4  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  27.68 
 
 
396 aa  57  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  31.34 
 
 
433 aa  57  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1119  peptidase M23B  38.57 
 
 
669 aa  57  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  33.66 
 
 
411 aa  57  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  37.5 
 
 
380 aa  56.6  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  32.54 
 
 
382 aa  56.6  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  32.06 
 
 
444 aa  56.6  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  26.82 
 
 
456 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>