More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2071 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  100 
 
 
477 aa  920    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  45.44 
 
 
471 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  47.1 
 
 
463 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  44.21 
 
 
448 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  43.9 
 
 
450 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  45.01 
 
 
469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  45.82 
 
 
461 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  46.62 
 
 
445 aa  345  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  46.86 
 
 
430 aa  327  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  43.18 
 
 
459 aa  326  6e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  44.74 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  44.09 
 
 
466 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  44.09 
 
 
466 aa  313  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  41.98 
 
 
458 aa  309  8e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  41.72 
 
 
457 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  40.77 
 
 
455 aa  290  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  39.18 
 
 
423 aa  272  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  36.11 
 
 
440 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  36.4 
 
 
478 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  36.57 
 
 
449 aa  258  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  36.57 
 
 
449 aa  256  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  35.78 
 
 
491 aa  247  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  37.68 
 
 
465 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  37.11 
 
 
467 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  36.28 
 
 
446 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  29.58 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  31.55 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  29.66 
 
 
350 aa  123  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  37.08 
 
 
491 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  31.02 
 
 
370 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  31 
 
 
370 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  30.86 
 
 
370 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  30.93 
 
 
413 aa  96.7  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  28.25 
 
 
367 aa  96.3  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  25.97 
 
 
411 aa  95.5  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  30.29 
 
 
414 aa  94.7  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  26.26 
 
 
367 aa  91.7  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  23.14 
 
 
374 aa  90.1  9e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  35.29 
 
 
392 aa  87  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  29.01 
 
 
405 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  26.97 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  26.78 
 
 
412 aa  84  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.66 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  25.13 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  25.83 
 
 
420 aa  79.7  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  28.93 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.12 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  29.1 
 
 
370 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  24.73 
 
 
428 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25.33 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  35.64 
 
 
387 aa  73.9  0.000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  26.6 
 
 
438 aa  73.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  25.69 
 
 
416 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  26.55 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  40 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  29.05 
 
 
372 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  29.61 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  28.49 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  23.86 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  31.18 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  26.26 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  32.45 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  23.63 
 
 
380 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  28.5 
 
 
481 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  27.54 
 
 
477 aa  68.2  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  23.63 
 
 
380 aa  67.8  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  27.33 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  27.33 
 
 
436 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  34.15 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  24.67 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  24.63 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  29.82 
 
 
430 aa  66.6  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.63 
 
 
441 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  23.21 
 
 
375 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  28.23 
 
 
381 aa  65.5  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  26.74 
 
 
426 aa  65.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  23.53 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  37.25 
 
 
301 aa  64.7  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.4 
 
 
397 aa  63.9  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  22.83 
 
 
363 aa  63.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  23.81 
 
 
377 aa  63.5  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  24.28 
 
 
397 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  23.48 
 
 
404 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.58 
 
 
434 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  23.4 
 
 
444 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  38.24 
 
 
299 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  29.76 
 
 
411 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  22.64 
 
 
379 aa  62.4  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.28 
 
 
391 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  33.87 
 
 
381 aa  61.6  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  21.19 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  24.73 
 
 
413 aa  60.5  0.00000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  38.78 
 
 
333 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.93 
 
 
394 aa  60.5  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1122  peptidase M23B  36.04 
 
 
298 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1193  peptidase M23B  36.04 
 
 
298 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.8562  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  24.73 
 
 
369 aa  60.1  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  32.74 
 
 
283 aa  60.1  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  32.11 
 
 
375 aa  60.1  0.00000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1123  peptidase M23B  36.04 
 
 
298 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>