More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0524 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  87.58 
 
 		 450 aa  749    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  100 
 
 		 469 aa  932    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  75.98 
 
 		 448 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  73.49 
 
 		 463 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  73.3 
 
 		 461 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  71.46 
 
 		 471 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  75.44 
 
 		 445 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  46.89 
 
 		 459 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  45.01 
 
 		 477 aa  359  7e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  48.3 
 
 		 457 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  43.25 
 
 		 466 aa  333  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  43.08 
 
 		 458 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  49.73 
 
 		 440 aa  331  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  43.25 
 
 		 466 aa  332  1e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  41.91 
 
 		 455 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  47.31 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  44.89 
 
 		 478 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  41.2 
 
 		 423 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  43.22 
 
 		 491 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  42.97 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  41.09 
 
 		 465 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  39.85 
 
 		 449 aa  263  4.999999999999999e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  39.85 
 
 		 449 aa  263  6e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  42.93 
 
 		 467 aa  262  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  32.31 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  37.15 
 
 		 446 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  34.81 
 
 		 401 aa  186  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  41.55 
 
 		 491 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  30.03 
 
 		 350 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  31.46 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  30.06 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  28.7 
 
 		 370 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  27.37 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  28.12 
 
 		 370 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  26.15 
 
 		 411 aa  113  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  26.63 
 
 		 367 aa  110  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  25.46 
 
 		 404 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  26.91 
 
 		 386 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  38.3 
 
 		 392 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  29.19 
 
 		 367 aa  102  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  25.62 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  27.36 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  24.14 
 
 		 394 aa  98.2  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  28.85 
 
 		 449 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.15 
 
 		 391 aa  97.4  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  26.81 
 
 		 430 aa  97.1  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  25.93 
 
 		 436 aa  93.6  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.64 
 
 		 397 aa  94  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  23.19 
 
 		 374 aa  93.6  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  26.21 
 
 		 436 aa  93.2  8e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  29.09 
 
 		 405 aa  91.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  24.08 
 
 		 416 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  22.28 
 
 		 397 aa  89.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.95 
 
 		 388 aa  89.4  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  27.91 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.78 
 
 		 428 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  22.9 
 
 		 381 aa  88.2  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  21.04 
 
 		 396 aa  88.2  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  25.63 
 
 		 424 aa  87.8  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  27.78 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  22.72 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  26.88 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  24.63 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  32.88 
 
 		 411 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  25.47 
 
 		 434 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  23.01 
 
 		 438 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  30.38 
 
 		 481 aa  80.9  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  23.08 
 
 		 438 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  23.08 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  25.58 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  33.33 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  27.05 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  25.06 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  24.77 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  23.67 
 
 		 366 aa  78.2  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  25.89 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  34.29 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  31.21 
 
 		 477 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  24.63 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  22.97 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  22.51 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  23.73 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  30.56 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  25.36 
 
 		 363 aa  75.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  23.4 
 
 		 362 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  24.31 
 
 		 377 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  25.55 
 
 		 456 aa  73.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  25.55 
 
 		 456 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  23.38 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  22.42 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  25.55 
 
 		 456 aa  72.4  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  21.99 
 
 		 404 aa  72.4  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  23.16 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  22.91 
 
 		 362 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  22.08 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  24.94 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  22.91 
 
 		 362 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  27.46 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>