More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1218 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  100 
 
 
387 aa  791    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  25.73 
 
 
397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.91 
 
 
397 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  34.74 
 
 
430 aa  125  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.3 
 
 
398 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  28.15 
 
 
404 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  32.8 
 
 
394 aa  110  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  27 
 
 
391 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  24.94 
 
 
388 aa  107  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  24.67 
 
 
379 aa  106  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  35.29 
 
 
370 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  28.04 
 
 
396 aa  105  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  25.7 
 
 
378 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  24.25 
 
 
387 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  39.39 
 
 
372 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  26.85 
 
 
382 aa  101  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  28.51 
 
 
436 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  26.6 
 
 
381 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  23.42 
 
 
458 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  38.64 
 
 
373 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  24.3 
 
 
377 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  38.64 
 
 
372 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  35.56 
 
 
428 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  38.46 
 
 
417 aa  96.7  7e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  32.3 
 
 
375 aa  96.3  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  23.66 
 
 
420 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.92 
 
 
428 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  33.33 
 
 
434 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  24.09 
 
 
416 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.43 
 
 
440 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  29.17 
 
 
503 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  38.1 
 
 
427 aa  94  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  24.32 
 
 
376 aa  93.2  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  26.45 
 
 
372 aa  93.6  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  32.21 
 
 
456 aa  93.2  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  32.21 
 
 
456 aa  93.2  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  32.21 
 
 
456 aa  93.2  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  37.24 
 
 
440 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  35.56 
 
 
441 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  33.8 
 
 
491 aa  92.4  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  24.04 
 
 
463 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  24.89 
 
 
440 aa  92.8  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  37.3 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  37.3 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  35.07 
 
 
481 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  34.75 
 
 
472 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  27 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  23.97 
 
 
471 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  34.75 
 
 
472 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  37.3 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  37.3 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  37.3 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  26.13 
 
 
369 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  24.42 
 
 
461 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  30.64 
 
 
404 aa  90.9  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  37.88 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  32.34 
 
 
424 aa  90.5  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  37.3 
 
 
427 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  31.61 
 
 
433 aa  90.1  6e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  36.23 
 
 
400 aa  90.1  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  26.32 
 
 
426 aa  89.7  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  26.97 
 
 
366 aa  89.7  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  29.28 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  35.17 
 
 
430 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  25.88 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  33.33 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  25.57 
 
 
375 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  33.33 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  24.69 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  25.75 
 
 
379 aa  87.8  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  27.31 
 
 
361 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  35.71 
 
 
433 aa  87.4  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  24.34 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  24.06 
 
 
362 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  27.71 
 
 
420 aa  87  5e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  36.51 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  34.67 
 
 
455 aa  86.7  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  31.1 
 
 
382 aa  86.3  9e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  37.3 
 
 
444 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  34.97 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  33.13 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  30.07 
 
 
516 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  31.95 
 
 
458 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  25.8 
 
 
400 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  23.37 
 
 
381 aa  84  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  25 
 
 
495 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  38.76 
 
 
450 aa  83.2  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  29.81 
 
 
367 aa  83.6  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  27.73 
 
 
362 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  27.4 
 
 
377 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  33.33 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.312919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>