More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1838 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  894    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  86.76 
 
 		 440 aa  739    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  99.78 
 
 		 449 aa  892    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  48.72 
 
 		 423 aa  382  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  47.3 
 
 		 478 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  48.31 
 
 		 465 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  47.45 
 
 		 467 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  42.89 
 
 		 491 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  40.36 
 
 		 420 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  39.49 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  38.37 
 
 		 466 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  41.63 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  38.37 
 
 		 466 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  43.16 
 
 		 440 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  37.39 
 
 		 455 aa  280  4e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  39.95 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  40.24 
 
 		 430 aa  276  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  43.5 
 
 		 463 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  41.5 
 
 		 461 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  38.95 
 
 		 459 aa  272  1e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  39.02 
 
 		 450 aa  265  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  41.29 
 
 		 469 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  38.44 
 
 		 457 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  40.48 
 
 		 445 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  36.13 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  35.85 
 
 		 446 aa  209  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  33.43 
 
 		 401 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  42.34 
 
 		 491 aa  125  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  30.79 
 
 		 350 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  26.76 
 
 		 411 aa  112  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  29.31 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  28.76 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  28 
 
 		 370 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  26.25 
 
 		 367 aa  99.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  26.93 
 
 		 367 aa  97.8  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  26.38 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  39.68 
 
 		 392 aa  91.3  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  28.45 
 
 		 449 aa  90.9  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  27.55 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  27.76 
 
 		 398 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  25.25 
 
 		 426 aa  86.7  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  31.31 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  25.06 
 
 		 412 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  32.05 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  31.36 
 
 		 397 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  32.57 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  25.42 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  33.71 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  30.5 
 
 		 394 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  32.52 
 
 		 404 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  28.36 
 
 		 396 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  36.03 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  24.03 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  31.34 
 
 		 411 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  22.77 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  26.17 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  31.65 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  21.77 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  29.71 
 
 		 398 aa  74.7  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  24.11 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  21.22 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4343  Peptidase M23  36.3 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  31.25 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.17 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  21.29 
 
 		 436 aa  72.8  0.00000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  32.35 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  30.66 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  30.66 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  26.67 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  22.97 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  23.84 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  30.14 
 
 		 477 aa  71.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  24.94 
 
 		 430 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  30.66 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  24.11 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  22.48 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  22.68 
 
 		 420 aa  68.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  23.79 
 
 		 375 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  31.97 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  26.94 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  26.94 
 
 		 456 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  32.35 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  25.93 
 
 		 456 aa  67  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  23.29 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  31.91 
 
 		 381 aa  67  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  25.2 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  21.13 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  30.66 
 
 		 405 aa  66.6  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  23.29 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  23.29 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  23.29 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.02 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  23.29 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  23.29 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  23.29 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  23.29 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  27.74 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  28.89 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  22.99 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  23.29 
 
 		 419 aa  65.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>