More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2546 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  100 
 
 		 413 aa  775    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  49.58 
 
 		 414 aa  280  4e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  47.37 
 
 		 405 aa  239  5e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  32.25 
 
 		 469 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  28.17 
 
 		 461 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  30.1 
 
 		 463 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  29.44 
 
 		 450 aa  123  5e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  28.76 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  28.06 
 
 		 445 aa  119  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  29.3 
 
 		 455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  30.92 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  27.98 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  31.18 
 
 		 440 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  28 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  30.25 
 
 		 466 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  30.25 
 
 		 466 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  31.52 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  29.14 
 
 		 446 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  38.51 
 
 		 491 aa  107  3e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  28.11 
 
 		 458 aa  107  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  27.88 
 
 		 465 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  26.65 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  27.73 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  22.92 
 
 		 420 aa  97.1  5e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  26.44 
 
 		 467 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  27.48 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  26.12 
 
 		 449 aa  90.5  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  25.87 
 
 		 449 aa  89.4  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  28.07 
 
 		 401 aa  88.2  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  25.36 
 
 		 491 aa  87  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  26.6 
 
 		 366 aa  80.5  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  26.41 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  25.33 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  31.14 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  31.62 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  31.29 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  34.75 
 
 		 394 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  33.05 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  35.09 
 
 		 477 aa  73.2  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  30.54 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  38.26 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  28.86 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  33.86 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  35.9 
 
 		 449 aa  70.9  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  30.81 
 
 		 481 aa  70.5  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  31.08 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  30.33 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  31.97 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  35.25 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  35.25 
 
 		 373 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  29.84 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  32.32 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  29.19 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  33.33 
 
 		 387 aa  68.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  29.11 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  29.17 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.89 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  28.74 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  28.74 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  28.74 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  34.81 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  31.03 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  28.32 
 
 		 361 aa  63.9  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  33.33 
 
 		 436 aa  63.2  0.000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.74 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  33.61 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  28.57 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0059  M24/M37 family peptidase  27.87 
 
 		 190 aa  62  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.447213  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  30.83 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  30 
 
 		 602 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  29.03 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  28.23 
 
 		 478 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  30.83 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  32.77 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  29.33 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  30.83 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  31.71 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  30 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  27.33 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  30 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  28.23 
 
 		 464 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  30 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  32.79 
 
 		 465 aa  60.5  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  30 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  30 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  22.69 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  30 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  27.91 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.56 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  26.32 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  24 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  28.99 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  24.67 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  23.36 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  30.83 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>