More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0567 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  86.32 
 
 		 461 aa  777    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  78.82 
 
 		 448 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  100 
 
 		 471 aa  931    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  77.99 
 
 		 463 aa  696    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  76.59 
 
 		 469 aa  616  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  69.91 
 
 		 450 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  72.68 
 
 		 445 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  46.53 
 
 		 477 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  51.44 
 
 		 459 aa  362  8e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  46.83 
 
 		 457 aa  344  2e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  49.74 
 
 		 458 aa  344  2e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  49.48 
 
 		 466 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  49.48 
 
 		 466 aa  342  8e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  50.53 
 
 		 440 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  44.32 
 
 		 455 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  44.76 
 
 		 430 aa  329  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  44.31 
 
 		 478 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  40.74 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  41.25 
 
 		 423 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  40.45 
 
 		 491 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  40.83 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  40.83 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  41.29 
 
 		 465 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  40.89 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  38.94 
 
 		 446 aa  240  5e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  31.98 
 
 		 420 aa  228  1e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  34.93 
 
 		 401 aa  180  5.999999999999999e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  32.72 
 
 		 350 aa  137  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  41.13 
 
 		 491 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  26.79 
 
 		 367 aa  108  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  29.91 
 
 		 414 aa  106  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  26.91 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  28.61 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  28.33 
 
 		 370 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  25.58 
 
 		 411 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.3 
 
 		 391 aa  103  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.67 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.13 
 
 		 394 aa  100  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  28.48 
 
 		 413 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  36.17 
 
 		 392 aa  99.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  27.3 
 
 		 367 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  25.82 
 
 		 366 aa  97.8  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  28.02 
 
 		 404 aa  97.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  25.99 
 
 		 386 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  25.43 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  26.03 
 
 		 428 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  22.61 
 
 		 416 aa  94  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  23.22 
 
 		 396 aa  93.2  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  21.68 
 
 		 374 aa  93.2  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.8 
 
 		 387 aa  92.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  30.04 
 
 		 430 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.46 
 
 		 397 aa  90.9  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  22.42 
 
 		 397 aa  91.3  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  25.42 
 
 		 398 aa  90.9  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.6 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.82 
 
 		 387 aa  89.4  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  28.91 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  23.9 
 
 		 440 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  22.42 
 
 		 379 aa  89  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  25.17 
 
 		 436 aa  88.2  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  28.06 
 
 		 449 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  26.01 
 
 		 436 aa  87  7e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  22.79 
 
 		 441 aa  86.7  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  25.89 
 
 		 432 aa  86.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  34.46 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  33.57 
 
 		 372 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  24.5 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  34.29 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  22.99 
 
 		 434 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  28.23 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  35 
 
 		 370 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  34.29 
 
 		 372 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  23.65 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  22.54 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  30.19 
 
 		 481 aa  80.1  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  28.12 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  22.95 
 
 		 438 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  27.45 
 
 		 411 aa  79.7  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  24.06 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  32.64 
 
 		 477 aa  77.8  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  22.73 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  25.87 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  24.55 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  22.42 
 
 		 404 aa  73.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  30.14 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  21.28 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  26.49 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  21.2 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  22.92 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  22.74 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  23.89 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  25.94 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  20.67 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.51 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  23.76 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  24.43 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  34.39 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  26.34 
 
 		 378 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  29.85 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>