More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4723 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  100 
 
 
350 aa  677    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  32 
 
 
463 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  32.71 
 
 
423 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  31.8 
 
 
471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  32.17 
 
 
455 aa  134  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  30 
 
 
461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  29.66 
 
 
448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  29.25 
 
 
450 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  31.52 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  33.74 
 
 
440 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  30.42 
 
 
440 aa  127  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  30.03 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  32.3 
 
 
430 aa  124  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  30.49 
 
 
449 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  30.49 
 
 
449 aa  124  3e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  30.52 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  30.52 
 
 
466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  29.95 
 
 
458 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  29.66 
 
 
477 aa  119  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  29.07 
 
 
465 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  30.16 
 
 
401 aa  113  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  28.8 
 
 
467 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  32.52 
 
 
367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  24.72 
 
 
420 aa  105  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  30.06 
 
 
491 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  28.39 
 
 
367 aa  99.8  6e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  28.81 
 
 
370 aa  99.4  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  27.19 
 
 
459 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  39.84 
 
 
478 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  31.35 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  36.57 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  30.7 
 
 
405 aa  90.9  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  37.24 
 
 
491 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  28 
 
 
370 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  25.95 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  36.72 
 
 
457 aa  85.5  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  28 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  38.35 
 
 
392 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  33.85 
 
 
411 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  25.5 
 
 
413 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  33.51 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  24.5 
 
 
411 aa  74.7  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  32.54 
 
 
455 aa  72.8  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  31.12 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  32.86 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  24.32 
 
 
366 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  25.45 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  25.45 
 
 
436 aa  71.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  26.56 
 
 
582 aa  72  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  31.87 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  32.79 
 
 
370 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  37.4 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  31.4 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  34.68 
 
 
388 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  30.24 
 
 
410 aa  68.6  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  32.95 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  34.48 
 
 
449 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  32.95 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  36.59 
 
 
433 aa  67  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  25.68 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  39.34 
 
 
405 aa  66.2  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  33.33 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  30.41 
 
 
375 aa  65.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  24.79 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  23.29 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  28.06 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1073  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  36.64 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  65.1  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  31.97 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.09 
 
 
430 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  32.06 
 
 
735 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  29.9 
 
 
456 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  29.9 
 
 
456 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  29.9 
 
 
456 aa  63.9  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  24.41 
 
 
413 aa  63.9  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  29.29 
 
 
378 aa  63.9  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  25.58 
 
 
374 aa  63.5  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2116  peptidase M23B  31.4 
 
 
295 aa  63.5  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.046362  normal  0.381161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  35.37 
 
 
424 aa  63.5  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1142  Peptidase M23  29.75 
 
 
274 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.405042 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  36.78 
 
 
243 aa  62.8  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  30.71 
 
 
290 aa  62.8  0.000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  33.33 
 
 
307 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1050  Peptidase M23  29.75 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.515696  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2096  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  30.58 
 
 
287 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  30.65 
 
 
412 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1285  Peptidase M23  33.07 
 
 
246 aa  62  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.780134  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  36.46 
 
 
307 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2839  Peptidase M23  34.43 
 
 
236 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.882621  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  24.08 
 
 
369 aa  62  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  31.2 
 
 
301 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2008  Peptidase M23  28 
 
 
602 aa  61.2  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  30.99 
 
 
382 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1826  peptidase M23B  30.46 
 
 
264 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  32.16 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  27.72 
 
 
361 aa  61.2  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.02 
 
 
235 aa  61.6  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1206  lipoprotein NLPD/LppB-like protein  30.08 
 
 
268 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  30.4 
 
 
398 aa  60.8  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  30.25 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>