More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3015 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3015  peptidase M23B  100 
 
 		 478 aa  934    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.180864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3884  Peptidase M23  63.37 
 
 		 465 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0398699 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4208  Peptidase M23  62.53 
 
 		 467 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.197588 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4299  hypothetical protein  55.7 
 
 		 491 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0124311  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  48.9 
 
 		 440 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  49.05 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  49.29 
 
 		 449 aa  374  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3452  peptidase M23B  44.93 
 
 		 423 aa  323  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.106399  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0567  peptidase M23B  44.63 
 
 		 471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0524  peptidase M23B  44.99 
 
 		 469 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.204903  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0165  peptidase M23B  43.25 
 
 		 448 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0163  Peptidase M23  44.67 
 
 		 463 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0448  peptidase M23B  43.78 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201796  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4732  Peptidase M23  42.21 
 
 		 440 aa  296  6e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189626  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2932  peptidase M23  39.82 
 
 		 459 aa  292  8e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0257  peptidase M23B  43.42 
 
 		 461 aa  292  9e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0644  Peptidase M23  42.04 
 
 		 457 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0328694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0099  peptidase M23  40.45 
 
 		 455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4222  peptidase M23B  43.77 
 
 		 430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.831503  normal  0.130137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2563  Peptidase M23  40.66 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2288  peptidase M23B  40.66 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.103425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2245  Peptidase M23  40.33 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.587035  normal  0.487877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0415  hypothetical protein  42.45 
 
 		 445 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2071  peptidase M23B  38.39 
 
 		 477 aa  259  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.435077  normal  0.225053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0323  M23 peptidase domain-containing protein  34.42 
 
 		 420 aa  251  2e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1473  peptidase M23B  38.83 
 
 		 446 aa  229  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.758633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2795  peptidase M23B  31.52 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4723  peptidase M23B  33.12 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.452825  normal  0.12326 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2592  peptidase M23B  29.34 
 
 		 370 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.638957  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0933  hypothetical protein  29.59 
 
 		 370 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0950283  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2982  peptidase M23B  27.16 
 
 		 370 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.795693  normal  0.113322 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1233  peptidase M23B  36.43 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0090  peptidase M23B  28.79 
 
 		 367 aa  108  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0628683  normal  0.786145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0380  peptidase M23B  27.78 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2756  peptidase M23B  26.39 
 
 		 367 aa  101  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.122209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2546  peptidase M23B  29.09 
 
 		 413 aa  97.1  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.532046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  34.55 
 
 		 405 aa  91.3  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  26.78 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0904  peptidase M23B  40.5 
 
 		 392 aa  88.6  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  27.25 
 
 		 412 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  30.45 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  22.89 
 
 		 366 aa  87.4  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2507  peptidase M23B  24.72 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.92 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3022  Peptidase M23  26.4 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.051505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  26.68 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  26.68 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  33.55 
 
 		 398 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  26.91 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  32.12 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  26.49 
 
 		 387 aa  78.6  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.67 
 
 		 397 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  33.33 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  26.43 
 
 		 441 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  30.13 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  20.77 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  31.79 
 
 		 379 aa  74.7  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  25.67 
 
 		 398 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  30.47 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  25.25 
 
 		 428 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0575  peptidase M23B  27.83 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  32.37 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  28.2 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  28.04 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  30.94 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  25.55 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  29.2 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  28.14 
 
 		 477 aa  70.5  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  23 
 
 		 426 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  30.5 
 
 		 391 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  25.84 
 
 		 509 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  23.41 
 
 		 378 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  29.69 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1307  peptidase M23B  36.59 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.654603 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  29.69 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  29.29 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  23.76 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  29.41 
 
 		 413 aa  66.6  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  22.08 
 
 		 387 aa  66.6  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  30 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  28.68 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  23.97 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  27.14 
 
 		 404 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  26.62 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  26.62 
 
 		 456 aa  64.7  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  26.62 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  26.72 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  21.94 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  27.34 
 
 		 381 aa  62.8  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  24.44 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  24.27 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  27.98 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.26 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  22.43 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0837  peptidoglycan-binding protein LysM  33.86 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.239144  normal  0.258287 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1212  peptidase M23B  30.15 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  33.6 
 
 		 299 aa  62  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  21.63 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  27.03 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  28.46 
 
 		 417 aa  61.6  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>