More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4343 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4343  Peptidase M23  100 
 
 
248 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  34.96 
 
 
445 aa  84.7  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  37.59 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  38.84 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  37.12 
 
 
370 aa  82  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  37.12 
 
 
373 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  37.59 
 
 
394 aa  81.6  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  37.12 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  36.36 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.43 
 
 
249 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  36.36 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  31.45 
 
 
530 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  31.45 
 
 
534 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  31.71 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  37.4 
 
 
538 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  38.76 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  35.83 
 
 
501 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3330  Peptidase M23  38.02 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0172603  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  36.5 
 
 
446 aa  75.9  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0056  peptidase M23B  39.32 
 
 
414 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  35.83 
 
 
537 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0107  peptidase M23B  35.11 
 
 
278 aa  75.1  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3996  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  34.68 
 
 
509 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  35.48 
 
 
321 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  33.33 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  32.58 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  35 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1838  hypothetical protein  36.3 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.331225  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1771  hypothetical protein  36.3 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  34.17 
 
 
494 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  35.04 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  35.04 
 
 
447 aa  73.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5080  peptidase M23B  41.18 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1947  Peptidase M23  41.67 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.653444  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  33.61 
 
 
468 aa  72  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5407  stage II sporulation protein  42.16 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.388576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5131  stage II sporulation protein  42.16 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5547  stage II sporulation protein  42.16 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00247023  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4964  stage II sporulation protein Q  42.16 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000820268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4982  stage II sporulation protein Q  42.16 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5524  stage II sporulation protein  42.16 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1767  peptidase M23B  34.65 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5373  stage II sporulation protein  42.16 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0925388 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  35.38 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5458  stage II sporulation protein  42.16 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000429439  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5403  stage II sporulation protein  42.16 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000422093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  36.97 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3801  peptidase M23B  41.18 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.769229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  34.71 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  36.97 
 
 
427 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1061  peptidase M23B  35.56 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  34.81 
 
 
383 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  37.61 
 
 
316 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  37.12 
 
 
455 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  33.6 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  31.93 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  31.93 
 
 
471 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  32.8 
 
 
399 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  33.61 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  34.68 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  38.83 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  31.93 
 
 
451 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  31.93 
 
 
455 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  37.4 
 
 
455 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  34.68 
 
 
271 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  36.29 
 
 
420 aa  69.3  0.00000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  35.16 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  34.71 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  34.18 
 
 
420 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  33.06 
 
 
241 aa  68.9  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3913  peptidase M23B  36.45 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  32.35 
 
 
375 aa  68.6  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2044  Peptidase M23  32.82 
 
 
272 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  33.96 
 
 
400 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  33.9 
 
 
314 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.77 
 
 
524 aa  68.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  33.96 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  36.59 
 
 
453 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  33.96 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  37.37 
 
 
271 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3774  peptidase M23B  34.92 
 
 
266 aa  67.8  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  29.35 
 
 
363 aa  67.4  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  32.5 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1671  peptidase M23B  35.71 
 
 
454 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  35.25 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  32.41 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  29.71 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0190  Peptidase M23  33.66 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2292  Peptidase M23  31.97 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  36.13 
 
 
509 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  34.29 
 
 
418 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  34.34 
 
 
442 aa  67  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  33.61 
 
 
449 aa  67  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  32.28 
 
 
425 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0370  peptidase M23B  34.35 
 
 
376 aa  67  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2484  peptidase M23B  35.58 
 
 
313 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  27.84 
 
 
332 aa  67  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  32.28 
 
 
412 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.38 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  34.45 
 
 
438 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>