More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2617 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2617  peptidase M23B  100 
 
 		 306 aa  624  1e-178  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0107  peptidase M23B  32.07 
 
 		 278 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1795  Peptidase M23  28.3 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0282  Peptidase M23  30.52 
 
 		 263 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.178127  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0110  M23/M37 peptidase domain-containing protein  39.55 
 
 		 343 aa  97.1  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.236132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  37.23 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  38.14 
 
 		 385 aa  86.7  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  50 
 
 		 420 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  50 
 
 		 425 aa  85.9  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  50 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  35.81 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  50 
 
 		 400 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  50 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  50 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2837  Peptidase M23  40.19 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  41.67 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  40.57 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  40.57 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0305  peptidase M23  45.37 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0127827  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  39.23 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  36.6 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2199  Peptidase M23  42.16 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  36.49 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  49 
 
 		 425 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2983  peptidase M23B  34.03 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17750  peptidase M23B  32.62 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  38.89 
 
 		 386 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  37.96 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3453  peptidase M23B  34.33 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1633  hypothetical protein  42.45 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0315  peptidase M23B  37.69 
 
 		 346 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.612531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3209  Peptidase M23  34.03 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.626752  normal  0.571204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  42.86 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1041  peptidase, M23/M37 family  41.44 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.432604  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  36.29 
 
 		 524 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  42.59 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  41.35 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  34.72 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  35.96 
 
 		 386 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  28.65 
 
 		 538 aa  80.1  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0470  M24/M37 family peptidase  34.59 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  32.12 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2410  peptidoglycan-binding LysM  42.99 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000688679  unclonable  0.000000112748 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  39.09 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  33.14 
 
 		 308 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  34.09 
 
 		 430 aa  79.3  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  34.67 
 
 		 389 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  38.52 
 
 		 462 aa  79.3  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  35.82 
 
 		 363 aa  79.3  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  35.88 
 
 		 321 aa  79  0.00000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3286  Peptidase M23  40.91 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1230  M24/M37 family peptidase  41.9 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.448984  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  39.81 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  37.96 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  41.18 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  36.43 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  37.86 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  34.07 
 
 		 283 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  32.14 
 
 		 503 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  30.26 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0442  peptidase M23B  33.83 
 
 		 285 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.639525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0548  peptidase M23B  35.21 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00447609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2373  peptidase M23B  27.96 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  40.95 
 
 		 473 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2548  Peptidase M23  37.88 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000368536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  34.84 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  38.52 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.95 
 
 		 475 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  38.06 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  33.09 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.95 
 
 		 473 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  34.33 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  37.4 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  40.95 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  39.42 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  40.95 
 
 		 414 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  34.81 
 
 		 457 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  38.24 
 
 		 468 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  28.7 
 
 		 621 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  35.48 
 
 		 527 aa  75.9  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  39.22 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  31.37 
 
 		 323 aa  75.9  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  35.56 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  30.77 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  30.77 
 
 		 477 aa  75.1  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1893  peptidase M23B  37.5 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  34.86 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  31.43 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  34.86 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1145  Peptidase M23  33.97 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  36 
 
 		 238 aa  75.5  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.95 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  38.1 
 
 		 442 aa  75.5  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2235  peptidase M23B  34.68 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000416895  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  33.97 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  34.53 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3777  peptidase M23B  28.8 
 
 		 283 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000155836  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1105  M24/M37 family peptidase  40.95 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  42.2 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1809  peptidase M23  34.62 
 
 		 414 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00301021 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>