More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1436 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  100 
 
 
369 aa  749    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0922  peptidase M23B  45.75 
 
 
383 aa  297  2e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.611629  normal  0.45806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  42.65 
 
 
458 aa  292  5e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  34.69 
 
 
382 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  32.14 
 
 
373 aa  222  9e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.82 
 
 
387 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  28.21 
 
 
388 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  27.58 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  22.67 
 
 
398 aa  95.5  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  39.06 
 
 
370 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  27.2 
 
 
382 aa  94  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  23.16 
 
 
377 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  38.46 
 
 
405 aa  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  23.34 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  25.27 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  26.16 
 
 
361 aa  90.5  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  36.09 
 
 
412 aa  90.5  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  29.24 
 
 
381 aa  89  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  23.98 
 
 
380 aa  89  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  36.22 
 
 
372 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  39.37 
 
 
373 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  25.98 
 
 
381 aa  88.2  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  39.37 
 
 
372 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  24.12 
 
 
378 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  25.84 
 
 
362 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  23.93 
 
 
404 aa  87.8  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  25.2 
 
 
376 aa  87.4  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  27.35 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  23.9 
 
 
380 aa  86.7  7e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  25.84 
 
 
362 aa  86.3  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  25.07 
 
 
362 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  22.89 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  22.89 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  24.48 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  25.53 
 
 
362 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  35.38 
 
 
426 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  27.22 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  20.6 
 
 
391 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  26.76 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  33.6 
 
 
481 aa  84  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  24.8 
 
 
374 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  36.44 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  30.8 
 
 
382 aa  83.2  0.000000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  35.88 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  26.19 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  36.67 
 
 
433 aa  83.2  0.000000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  26.76 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  35.16 
 
 
417 aa  83.2  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  31.33 
 
 
434 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  25.45 
 
 
375 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  24.76 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  24.76 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  36.36 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  23.12 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  24.33 
 
 
377 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  36.36 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  22.41 
 
 
396 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  24.76 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  36.36 
 
 
456 aa  82.8  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  25.26 
 
 
382 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  24.76 
 
 
419 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  24.53 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  35.07 
 
 
416 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  24.76 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  35.82 
 
 
398 aa  82  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  33.61 
 
 
411 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  37.29 
 
 
424 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  36.36 
 
 
387 aa  81.3  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  24.76 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  24.76 
 
 
427 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  29.92 
 
 
430 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  34.68 
 
 
428 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  36.07 
 
 
377 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  34.68 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  34.68 
 
 
438 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  34.15 
 
 
427 aa  79.7  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  34.68 
 
 
438 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  34.15 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  34.15 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  34.15 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  34.15 
 
 
427 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  36.75 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.54 
 
 
394 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  34.15 
 
 
427 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  22.99 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  34.15 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  34.35 
 
 
441 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  34.62 
 
 
477 aa  77  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  34.96 
 
 
432 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  30.47 
 
 
375 aa  76.6  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  28.35 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  23.51 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  36.44 
 
 
424 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  28.25 
 
 
440 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  36.64 
 
 
379 aa  75.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  38.61 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  21.92 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  23 
 
 
399 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  33.05 
 
 
444 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  30.71 
 
 
472 aa  72.8  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>