More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2869 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2869  Peptidase M23  100 
 
 		 373 aa  754    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  36.47 
 
 		 458 aa  237  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0922  peptidase M23B  37.77 
 
 		 383 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.611629  normal  0.45806 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  35.2 
 
 		 382 aa  229  7e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1436  M24/M37 family peptidase  32.14 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0228045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  25 
 
 		 387 aa  113  7.000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  25.8 
 
 		 381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.1 
 
 		 397 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  23.35 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.73 
 
 		 391 aa  106  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  31.36 
 
 		 388 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  20.82 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  21.78 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  26.16 
 
 		 405 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  31.88 
 
 		 370 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  21.74 
 
 		 394 aa  93.6  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  27.11 
 
 		 411 aa  93.6  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  25.23 
 
 		 404 aa  93.6  5e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  23.24 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  25.71 
 
 		 382 aa  92.8  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  24.61 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  23.4 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  28.53 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  37.8 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  37.6 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  34.31 
 
 		 412 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  35.43 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  37.9 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  36.22 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  37.9 
 
 		 377 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  28 
 
 		 404 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  26.22 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  36.22 
 
 		 372 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  24.05 
 
 		 430 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  36.8 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  36.8 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  37.1 
 
 		 362 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 382 aa  87.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  28.48 
 
 		 426 aa  87  5e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  36.29 
 
 		 362 aa  86.3  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  26.19 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  32.22 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  33.85 
 
 		 481 aa  85.1  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  34.88 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  23.34 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  35.48 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  23.38 
 
 		 382 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  23.81 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  24.11 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  24.37 
 
 		 402 aa  82.8  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  38.71 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  38.71 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  33.06 
 
 		 377 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  32.79 
 
 		 377 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  29.63 
 
 		 394 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3268  hypothetical protein  40.34 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  37.1 
 
 		 432 aa  81.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  34.43 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  38.14 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  38.14 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  38.14 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  38.14 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  26.7 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  38.14 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  24.8 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  35.48 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  24.82 
 
 		 433 aa  80.9  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3373  hypothetical protein  39.5 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.507543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3272  hypothetical protein  39.5 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3206  YgeR  39.5 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.317836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  25.63 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  38.14 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3193  LysM domain/M23 peptidase domain protein  39.5 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561609  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  38.14 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  38.14 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  34.43 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  34.43 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  34.43 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  31.15 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  34.43 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  34.43 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  34.43 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  37.29 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  33.33 
 
 		 428 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  30.89 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  33.58 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  33.33 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  77.8  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  33.33 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  28.74 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  30.1 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  33.86 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  34.43 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>