46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1562 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 370 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  75.56 
 
 		 369 aa  511  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  45.69 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  41.43 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.08 
 
 		 208 aa  72  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.06 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.7 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.18 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  37.74 
 
 		 493 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.3 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.3 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  36.07 
 
 		 644 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.05 
 
 		 395 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  33.33 
 
 		 958 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.38 
 
 		 1139 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  34.75 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  43.68 
 
 		 1438 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  43.02 
 
 		 1194 aa  50.4  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0391  SH3 type 3 domain-containing protein  34.75 
 
 		 510 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.744307 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2175  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.88 
 
 		 490 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.779763  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.21 
 
 		 232 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.08 
 
 		 524 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.01 
 
 		 1181 aa  48.9  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0977  SH3 type 3 domain protein  39.24 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00363101  normal  0.0377328 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  29.06 
 
 		 286 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.53 
 
 		 121 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.92 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.08 
 
 		 1412 aa  46.6  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  33.64 
 
 		 517 aa  46.6  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.66 
 
 		 313 aa  46.2  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1153  SH3 type 3 domain-containing protein  33.04 
 
 		 509 aa  46.2  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0474  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 364 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.674991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 		 1343 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.73 
 
 		 192 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0134  hypothetical protein  38.03 
 
 		 164 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  36.27 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2306  hypothetical protein  30.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.11 
 
 		 157 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.54 
 
 		 831 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  35.29 
 
 		 959 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0342  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.16 
 
 		 101 aa  44.3  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.649618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.91 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.58 
 
 		 1224 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1381  hypothetical protein  32.71 
 
 		 186 aa  43.9  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  38.03 
 
 		 164 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>