25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_196 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  100 
 
 		 164 aa  319  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0134  hypothetical protein  87.2 
 
 		 164 aa  282  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0219  HEAT repeat-containing PBS lyase  83.54 
 
 		 164 aa  263  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2169  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.347  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.53 
 
 		 1181 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  34.29 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  36.36 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  37.65 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  33.8 
 
 		 1148 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.13 
 
 		 157 aa  44.3  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.95 
 
 		 1412 aa  44.3  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.25 
 
 		 399 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.37 
 
 		 370 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  29.41 
 
 		 350 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.96 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.12 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.23 
 
 		 1438 aa  43.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.77 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.76 
 
 		 331 aa  42  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.4 
 
 		 1041 aa  42  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  28.47 
 
 		 493 aa  41.6  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2128  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.24 
 
 		 175 aa  41.2  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.146426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  25.79 
 
 		 1194 aa  40.8  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.1 
 
 		 173 aa  40.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>