19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0219 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0219  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 164 aa  318  1.9999999999999998e-86  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0134  hypothetical protein  84.76 
 
 		 164 aa  272  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  83.54 
 
 		 164 aa  263  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2169  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  32.28 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  34.75 
 
 		 1148 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1889  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.56 
 
 		 331 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.826607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1962  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.46 
 
 		 331 aa  47.8  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.88 
 
 		 1412 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0159  SH3 type 3 domain protein  29.21 
 
 		 350 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.333454  normal  0.0117135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.23 
 
 		 1181 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.64 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0617  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.89 
 
 		 1041 aa  44.7  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.639116  normal  0.314613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  29.2 
 
 		 493 aa  42.4  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.43 
 
 		 1438 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3319  SH3 type 3 domain-containing protein  32.94 
 
 		 321 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.03 
 
 		 251 aa  41.2  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3413  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.94 
 
 		 369 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0728578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0125  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.91 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1562  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.15 
 
 		 370 aa  40.4  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.544381  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>