54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2169 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2169  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 		 175 aa  348  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_196  PBS lyase heat-like repeat domain protein  35.14 
 
 		 164 aa  65.1  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.69738  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0134  hypothetical protein  34.46 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0219  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.28 
 
 		 164 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  39.64 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  36.11 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0822  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.36 
 
 		 200 aa  51.2  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.166674  normal  0.581812 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.19 
 
 		 287 aa  50.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  37.89 
 
 		 1148 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.6 
 
 		 395 aa  50.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  44 
 
 		 1438 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.91 
 
 		 1343 aa  49.7  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  36.56 
 
 		 493 aa  48.9  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3152  hypothetical protein  32.56 
 
 		 431 aa  48.5  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.119885  normal  0.0295401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0512  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  43.68 
 
 		 251 aa  48.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.31 
 
 		 510 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  34.51 
 
 		 958 aa  47.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.33 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.55 
 
 		 831 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  41.57 
 
 		 838 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.21 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.06 
 
 		 1412 aa  45.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  38.46 
 
 		 377 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  45 
 
 		 524 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  41.49 
 
 		 375 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.49 
 
 		 375 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  41.49 
 
 		 375 aa  45.1  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.49 
 
 		 375 aa  45.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.14 
 
 		 390 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  41.49 
 
 		 375 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  41.49 
 
 		 375 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  41.49 
 
 		 375 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.49 
 
 		 335 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  41.49 
 
 		 375 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.7 
 
 		 192 aa  44.3  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  41.76 
 
 		 375 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  37.36 
 
 		 381 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.46 
 
 		 221 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  42.05 
 
 		 375 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5719  HEAT domain containing protein  38.05 
 
 		 299 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5289  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.44 
 
 		 331 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460967  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.09 
 
 		 313 aa  42.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0515  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.56 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.75 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.36 
 
 		 214 aa  41.2  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.52 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0676  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.99 
 
 		 320 aa  41.2  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401005 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1094 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.73 
 
 		 666 aa  40.8  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  32.73 
 
 		 644 aa  40.8  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.65 
 
 		 334 aa  40.8  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 		 1139 aa  40.8  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3079  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.71 
 
 		 284 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3041  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.71 
 
 		 284 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>