133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1572 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  100 
 
 
377 aa  768    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  86.4 
 
 
381 aa  664    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  67.29 
 
 
375 aa  511  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  65.96 
 
 
375 aa  494  1e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  66.22 
 
 
375 aa  495  1e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  65.96 
 
 
375 aa  495  1e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  65.96 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  65.96 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  65.96 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  65.69 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  65.96 
 
 
375 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  64.89 
 
 
375 aa  487  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2231  HEAT repeat-containing PBS lyase  67.07 
 
 
335 aa  444  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000135622  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1489  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.41 
 
 
374 aa  323  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1518  HEAT repeat-containing PBS lyase  45.41 
 
 
374 aa  323  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  35.62 
 
 
1148 aa  77.4  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2129  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.97 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.846494  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.11 
 
 
1343 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.82 
 
 
1438 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0753  HEAT domain containing protein  38.76 
 
 
838 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  35.76 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5071  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  37.14 
 
 
831 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.886653  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1490  hypothetical protein  42.17 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1519  hypothetical protein  42.17 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3158  phycobiliprotein, putative  32.47 
 
 
320 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  33.74 
 
 
958 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.23 
 
 
510 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.5 
 
 
395 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.84 
 
 
192 aa  64.3  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5008  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.69 
 
 
321 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0697  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  33.11 
 
 
208 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0575876  normal  0.921461 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  29.38 
 
 
1094 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0210  phycobiliprotein, putative  31.65 
 
 
321 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.203679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2119  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.53 
 
 
668 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.25 
 
 
666 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1007  hypothetical protein  34.12 
 
 
86 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2690  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.93 
 
 
232 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0127412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4073  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.97 
 
 
325 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.429453  normal  0.578065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3137  HEAT repeat-containing PBS lyase  37.74 
 
 
370 aa  55.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000055982  hitchhiker  0.00466606 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3140  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.44 
 
 
670 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.56 
 
 
180 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2420  HEAT domain containing protein  29.6 
 
 
363 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  32.38 
 
 
493 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  33.33 
 
 
1139 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  30.63 
 
 
546 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
593 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.84 
 
 
220 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1251  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.91 
 
 
162 aa  52.8  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  30.08 
 
 
959 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  42.22 
 
 
1133 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0746  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  26.82 
 
 
646 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.38 
 
 
220 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.85 
 
 
1181 aa  51.2  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4287  HEAT repeat-domain-containing protein-like protein  32.03 
 
 
1194 aa  51.6  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.248989  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1862  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.58 
 
 
157 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.715493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.43 
 
 
223 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2744  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.61 
 
 
121 aa  50.1  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1572  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.89 
 
 
642 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.143951  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1531  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.95 
 
 
1412 aa  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0731666  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03351  HEAT repeat-containing PBS lyase  38.1 
 
 
285 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.158445  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.38 
 
 
313 aa  49.7  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2216  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.26 
 
 
667 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4092  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.92 
 
 
178 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.17 
 
 
1224 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.3 
 
 
226 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  31.33 
 
 
186 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2149  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.16 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.67 
 
 
200 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2803  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.79 
 
 
320 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.873153 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1681  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  31.03 
 
 
388 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.741729 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1669  HEAT repeat-containing PBS lyase  28.38 
 
 
173 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  40.91 
 
 
524 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0382  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.15 
 
 
221 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.651057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07440  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.35 
 
 
381 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4227  HEAT domain containing protein  24.88 
 
 
756 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  25.86 
 
 
187 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1674  HEAT repeat-containing PBS lyase  36.67 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.159661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0761  HEAT domain containing protein  23.35 
 
 
646 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.181899 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03881  HEAT repeat-containing protein  36.67 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.87651  normal  0.0403253 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22351  HEAT repeat-containing protein  38.27 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4511  HEAT domain containing protein  34.02 
 
 
286 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.715352  normal  0.801323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0754  hypothetical protein  30.59 
 
 
199 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000250438  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0251  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.12 
 
 
408 aa  47.4  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.169018  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1170  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.86 
 
 
150 aa  47  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2192  HEAT repeat-containing PBS lyase  32.84 
 
 
176 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.84 
 
 
214 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0432  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.08 
 
 
299 aa  47  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.326243  normal  0.0602885 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0517  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.302016  normal  0.633318 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4189  HEAT domain containing protein  30 
 
 
319 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3997  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  35.14 
 
 
168 aa  46.6  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.04 
 
 
220 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1896  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.83 
 
 
298 aa  46.2  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0437  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.07 
 
 
489 aa  46.2  0.0009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000498384  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2826  HEAT repeat-containing PBS lyase  30.83 
 
 
157 aa  46.2  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.176107 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1378  HEAT domain containing protein  27.15 
 
 
643 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.905373  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.53 
 
 
323 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.71 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.17 
 
 
285 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1313  hypothetical protein  33.33 
 
 
361 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2016  SH3 type 3 domain-containing protein  25.39 
 
 
773 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000554023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>