56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0437 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0437  HEAT repeat-containing PBS lyase  100 
 
 		 489 aa  976    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000498384  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3508  signal transduction protein  28.66 
 
 		 1148 aa  71.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.139224 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0049  HEAT domain containing protein  24.14 
 
 		 959 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0841  hypothetical protein  22.46 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.161077  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1323  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  25.71 
 
 		 212 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0115  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.76 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  26.74 
 
 		 1094 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0675  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.56 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  29.95 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.07 
 
 		 1343 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3394  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.2 
 
 		 524 aa  57  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.232744  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0933  hypothetical protein  30.72 
 
 		 958 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.471083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3019  phycocyanin alpha-subunit  28.23 
 
 		 546 aa  53.9  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.993507  hitchhiker  0.00737492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1201  HEAT repeat-containing protein  25.45 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.88812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3392  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.03 
 
 		 510 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323304 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0811  HEAT repeat-containing PBS lyase  29.53 
 
 		 192 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1817  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase  22.26 
 
 		 493 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0551014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0604  phycocyanin alpha phycocyanobilin lyase related protein  30.21 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1381  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.07 
 
 		 220 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0577  PBS lyase HEAT domain-containing protein repeat-containing protein  24.29 
 
 		 218 aa  51.6  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.166328  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1415  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  27.93 
 
 		 220 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4786  heat domain-containing protein  26.56 
 
 		 366 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1888  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.71 
 
 		 220 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.628238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1432  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  23.76 
 
 		 220 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1048  signal transduction protein  29.93 
 
 		 1216 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.958943  normal  0.02885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2732  HEAT domain containing protein  28.7 
 
 		 1133 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1721  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.37 
 
 		 234 aa  48.5  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1460  HEAT domain containing protein  33.33 
 
 		 165 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0030107  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1030  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.27 
 
 		 1139 aa  48.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.762033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0959  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.84 
 
 		 220 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  28.49 
 
 		 1328 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0978  HEAT repeat-containing PBS lyase  26.86 
 
 		 334 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0644536  normal  0.854239 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0746  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.56 
 
 		 313 aa  48.5  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.793568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0932  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.84 
 
 		 220 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1823  HEAT repeat-containing PBS lyase  23.73 
 
 		 219 aa  48.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.565572 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2887  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1181 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.371101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1824  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1224 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  30.07 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4548  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.5 
 
 		 226 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  23.86 
 
 		 593 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0930  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.34 
 
 		 835 aa  45.1  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2563  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  24.14 
 
 		 220 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2265  HEAT domain containing protein  28.77 
 
 		 402 aa  45.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0591737 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0779  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  28.57 
 
 		 641 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1221  hypothetical protein  31.06 
 
 		 291 aa  43.9  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4600  HEAT repeat-containing PBS lyase  31.25 
 
 		 214 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0925  hypothetical protein  27.39 
 
 		 517 aa  44.3  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2306  HEAT repeat-containing PBS lyase  22.98 
 
 		 666 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0987  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.48 
 
 		 285 aa  43.5  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.322977  normal  0.0540864 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79203  phycocyanin alpha-subunit phycocyanobilin lyase  24.03 
 
 		 318 aa  43.5  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0823  HEAT repeat-containing PBS lyase  27.81 
 
 		 180 aa  43.5  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.922694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  29.37 
 
 		 381 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4762  HEAT repeat-containing PBS lyase  24.66 
 
 		 223 aa  43.5  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.122338  normal  0.117024 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  32.56 
 
 		 742 aa  43.5  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1736  HEAT repeat-containing PBS lyase  25.32 
 
 		 1438 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.198352  normal  0.401891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0768  heat domain-containing protein  38.36 
 
 		 446 aa  43.1  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.270094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>