39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1007 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1007  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  176  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1519  hypothetical protein  59.76 
 
 		 83 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1490  hypothetical protein  59.76 
 
 		 83 aa  113  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1518  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.67 
 
 		 374 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1489  HEAT repeat-containing PBS lyase  47.67 
 
 		 374 aa  90.5  7e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.451629  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1616  HEAT repeat-containing PBS lyase  35.71 
 
 		 375 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000382095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2596  Scaffold protein Nfu/NifU  34.12 
 
 		 381 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2171  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.52 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0184822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1572  PBS lyase HEAT domain protein repeat-containing protein  34.12 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0581284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3139  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  34.52 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640173  normal  0.0140567 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2177  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  34.52 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000513448  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2314  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  34.52 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000816736  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2006  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.52 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000482717  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2017  HEAT repeat-containing PBS lyase  34.52 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1988  HEAT-like repeat-containing protein  34.52 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00393125  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1970  HEAT-like repeat-containing protein  34.52 
 
 		 375 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000496262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2194  PBS lyase HEAT-like repeat domain protein  34.52 
 
 		 375 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0153783 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  38.96 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  38.03 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  33.8 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  36.36 
 
 		 186 aa  49.3  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  35.21 
 
 		 188 aa  48.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  36.62 
 
 		 188 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  28.75 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  32.39 
 
 		 188 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  39.74 
 
 		 189 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  30.77 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  29.17 
 
 		 187 aa  44.3  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  29.58 
 
 		 190 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  23.94 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  25 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  34.83 
 
 		 191 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  30 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  41.18 
 
 		 326 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  30.99 
 
 		 188 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  31.65 
 
 		 180 aa  41.6  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  30.99 
 
 		 191 aa  40.8  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  31.51 
 
 		 188 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>