246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0036 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  100 
 
 		 188 aa  390  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  96.81 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  81.72 
 
 		 188 aa  313  7e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  79.68 
 
 		 186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  77.42 
 
 		 189 aa  301  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  71.12 
 
 		 190 aa  280  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  69.89 
 
 		 189 aa  279  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  71.66 
 
 		 190 aa  275  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  71.66 
 
 		 190 aa  275  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  65.41 
 
 		 188 aa  270  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  65.76 
 
 		 192 aa  260  6e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  66.84 
 
 		 186 aa  259  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  64.55 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  64.55 
 
 		 188 aa  258  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  67.04 
 
 		 188 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  64.02 
 
 		 188 aa  254  6e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  65.73 
 
 		 188 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  64.64 
 
 		 191 aa  249  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  66.29 
 
 		 188 aa  248  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  64.71 
 
 		 187 aa  248  3e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  62.16 
 
 		 187 aa  248  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  63.89 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  63.44 
 
 		 187 aa  241  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  66.14 
 
 		 188 aa  240  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  63.1 
 
 		 187 aa  239  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  63.49 
 
 		 187 aa  240  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  61.29 
 
 		 187 aa  237  5.999999999999999e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  61.83 
 
 		 186 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  60.22 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  59.68 
 
 		 183 aa  226  2e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  60.75 
 
 		 201 aa  226  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  63.44 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  57.81 
 
 		 190 aa  225  4e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  62.16 
 
 		 187 aa  224  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  61.83 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  54.5 
 
 		 192 aa  211  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  53.72 
 
 		 189 aa  204  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  52.63 
 
 		 187 aa  203  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  55.21 
 
 		 195 aa  202  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  57.53 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  53.26 
 
 		 191 aa  194  6e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  54.79 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  49.21 
 
 		 206 aa  185  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  46.32 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  43.68 
 
 		 254 aa  167  8e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  50.53 
 
 		 309 aa  165  4e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  42.93 
 
 		 326 aa  162  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  44.68 
 
 		 186 aa  161  6e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 		 183 aa  153  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.78 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  40.21 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  41.84 
 
 		 195 aa  143  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  41.18 
 
 		 191 aa  142  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.95 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  35.2 
 
 		 299 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  33.17 
 
 		 305 aa  109  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  36.27 
 
 		 200 aa  108  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  31.69 
 
 		 299 aa  95.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  28.19 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  27.42 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.55 
 
 		 72 aa  70.5  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2988  nitrogen-fixing NifU domain protein  25.27 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  42.25 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  46.77 
 
 		 72 aa  63.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.71 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  42.67 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  38.37 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46593  predicted protein  44.26 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.78436  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12230  thioredoxin-like protein  43.55 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000175361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  41.43 
 
 		 73 aa  62  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  46.97 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.93 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  45.16 
 
 		 72 aa  60.5  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  39.47 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 		 80 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  40.62 
 
 		 80 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  46.77 
 
 		 72 aa  61.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  39.47 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  44.29 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.79 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  38.1 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.38 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  45.76 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  42.62 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16946  predicted protein  40.68 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.62 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  39.71 
 
 		 281 aa  58.2  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1004  NifU family protein  43.33 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0012863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  40.68 
 
 		 81 aa  57.8  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  44.07 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  44.07 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  39.66 
 
 		 76 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.66 
 
 		 79 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  36.49 
 
 		 88 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  44.07 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  44.07 
 
 		 78 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.66 
 
 		 79 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>