265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1782 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  100 
 
 		 88 aa  180  7e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0061  NifU family protein  77.27 
 
 		 88 aa  149  2e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.269629  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1742  hypothetical protein  64.77 
 
 		 91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1004  NifU family protein  64.77 
 
 		 89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0012863  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1811  NifU family protein  65.06 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1999  NifU family protein  65.06 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1630  NifU family protein  65.06 
 
 		 90 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  59.04 
 
 		 91 aa  116  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0110  conserved hypothetical protein, NifU family protein  62.65 
 
 		 91 aa  116  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000197902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1940  nitrogen-fixing NifU domain protein  66.25 
 
 		 93 aa  95.1  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  50.75 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.94 
 
 		 72 aa  68.9  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.62 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  51.47 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.77 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.77 
 
 		 294 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  52.17 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  51.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  51.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  60 
 
 		 77 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  51.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  51.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  54.55 
 
 		 73 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  46.15 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  46.15 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  44.16 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  47.14 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  57.38 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  46.38 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  48.53 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.79 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  54.1 
 
 		 74 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  52.24 
 
 		 72 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  46.38 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  41.46 
 
 		 291 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  48.53 
 
 		 80 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  53.85 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  52.46 
 
 		 283 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  48.48 
 
 		 289 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  49.28 
 
 		 73 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  52.46 
 
 		 74 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.97 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  44.78 
 
 		 79 aa  63.5  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  36 
 
 		 190 aa  63.5  0.0000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  36 
 
 		 190 aa  63.5  0.0000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.06 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  42.86 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  47.22 
 
 		 74 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  44.16 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.33 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  46.77 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 73 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  39.19 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  37.11 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  47.06 
 
 		 81 aa  62  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0723  NifU domain-containing protein  53.12 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603746 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  50 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  36 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.95 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  45.76 
 
 		 73 aa  61.2  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  43.48 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  50 
 
 		 84 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  36 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  43.66 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  40.51 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  42.03 
 
 		 189 aa  60.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  54.24 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.15 
 
 		 73 aa  60.8  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  36 
 
 		 188 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3915  Fe-S cluster assembly protein NifU  42.11 
 
 		 300 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  39.19 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  40.54 
 
 		 187 aa  60.1  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  50.88 
 
 		 78 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.47 
 
 		 286 aa  60.1  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1326  NifU domain-containing protein  46.84 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  36.92 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3614  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.25 
 
 		 73 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187737  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  36.92 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  39.06 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  40.62 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0419  nitrogen-fixing NifU domain protein  48 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0336152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2015  NifU domain-containing protein  48 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000213209  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  39.44 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  36.62 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  48.61 
 
 		 89 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  43.48 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  39.13 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>