233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1742 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1742  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  186  8e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1004  NifU family protein  92.13 
 
 
89 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0012863  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0061  NifU family protein  77.27 
 
 
88 aa  153  9e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.269629  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  64.77 
 
 
88 aa  132  1.9999999999999998e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1811  NifU family protein  68.97 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1999  NifU family protein  68.97 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1630  NifU family protein  68.97 
 
 
90 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0110  conserved hypothetical protein, NifU family protein  61.9 
 
 
91 aa  121  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000197902  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  58.24 
 
 
91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1940  nitrogen-fixing NifU domain protein  62.92 
 
 
93 aa  95.9  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  45.83 
 
 
72 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 
72 aa  58.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.03 
 
 
294 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  46.03 
 
 
294 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  41.03 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  48.21 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.42 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.75 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  44 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  41.67 
 
 
188 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.74 
 
 
87 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  45.57 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  33.73 
 
 
186 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  42 
 
 
188 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  45.45 
 
 
74 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  53.7 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  45.57 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  38.16 
 
 
183 aa  55.1  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.1 
 
 
74 aa  55.1  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.54 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  46 
 
 
192 aa  54.3  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  44.12 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.15 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  35.38 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  39.13 
 
 
187 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  44 
 
 
186 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  35.38 
 
 
190 aa  53.9  0.0000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  38.33 
 
 
190 aa  53.9  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  44.93 
 
 
73 aa  53.5  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  47.46 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  33.78 
 
 
188 aa  53.9  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  41.18 
 
 
189 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0051  Fe-S cluster assembly protein NifU  41.27 
 
 
281 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49030  NifU C-terminal domain-containing protein, AnfU  35.44 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  34.67 
 
 
189 aa  53.5  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1697  nitrogen fixation protein NifU  42.31 
 
 
333 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0518954  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  44.62 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  42.25 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  42 
 
 
188 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  42 
 
 
188 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  44 
 
 
190 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  35.37 
 
 
291 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  44.93 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  44.12 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  41.1 
 
 
186 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0689  Fe-S cluster assembly protein NifU  32.91 
 
 
277 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0701297  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  40.85 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  43.48 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  44 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  34.18 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  34.85 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  42 
 
 
188 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1487  NifU-like protein  38.64 
 
 
323 aa  52.4  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  34.18 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  46.03 
 
 
75 aa  52  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  39.73 
 
 
186 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  42.47 
 
 
74 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  42.31 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  42.31 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  40 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  39.73 
 
 
186 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  42.31 
 
 
81 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  34.57 
 
 
187 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.45 
 
 
306 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.48 
 
 
73 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  44.07 
 
 
73 aa  51.2  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  38.33 
 
 
283 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  42 
 
 
191 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.03 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  33.33 
 
 
326 aa  50.8  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  41.1 
 
 
74 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.15 
 
 
73 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1162  acetolactate synthase small subunit  33.77 
 
 
330 aa  50.4  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2121  Fe-S cluster assembly protein NifU  47.06 
 
 
293 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  44.07 
 
 
187 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.56 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1355  Fe-S cluster assembly protein NifU  43.06 
 
 
306 aa  50.4  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.62 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  40.28 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  44 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>