More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3799 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  100 
 
 		 291 aa  587  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0476  nitrogen-fixing NifU domain protein  59.85 
 
 		 286 aa  319  3e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.140105  normal  0.34365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3228  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  46.79 
 
 		 289 aa  251  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.769303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2369  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1813  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.45 
 
 		 309 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0469  putative nitrogen-fixing NifU, Rieske (2Fe-2S) region  34.69 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.483541  normal  0.014762 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0710  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  37.07 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0858  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.07 
 
 		 301 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3755  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.56 
 
 		 290 aa  167  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3870  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  33.45 
 
 		 270 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1251  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.75 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1282  nitrogen-fixing NifU domain protein  32.75 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3205  nitrogen-fixing NifU-like  33.47 
 
 		 311 aa  137  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  33.82 
 
 		 306 aa  108  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2129  NifU domain-containing protein  34.25 
 
 		 294 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0750308  normal  0.014165 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2142  nitrogen-fixing NifU-like protein  33.33 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2188  NifU domain-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.226918 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3360  nitrogen-fixing NifU-like  35.06 
 
 		 173 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.595792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4600  nitrogen-fixing NifU-like  35.9 
 
 		 158 aa  89  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.357598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2413  NifU domain-containing protein  31.6 
 
 		 297 aa  87  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0708227  normal  0.256977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.63 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3815  hypothetical protein  34.69 
 
 		 186 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473897  normal  0.0339082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4593  nitrogen-fixing NifU domain protein  34.55 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5395  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  40.86 
 
 		 105 aa  69.7  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.26 
 
 		 109 aa  69.3  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 		 73 aa  69.3  0.00000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0473  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.56 
 
 		 99 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0073046  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.26 
 
 		 137 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.58 
 
 		 79 aa  68.2  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  47.06 
 
 		 75 aa  67.8  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0814  benzene 1,2-dioxygenase, ferredoxin protein  35.16 
 
 		 109 aa  67.8  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.96 
 
 		 106 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 72 aa  67.4  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.21 
 
 		 74 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2034  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.53 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  43.24 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  41.46 
 
 		 88 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.35 
 
 		 102 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4275  Rieske (2Fe-2S) region  34.62 
 
 		 106 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09103  apoptosis-inducing factor (Eurofung)  35.9 
 
 		 561 aa  64.3  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0266985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.44 
 
 		 81 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 79 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 79 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2526  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.98 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.672374  normal  0.0193911 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  47.89 
 
 		 76 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 72 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0450  putative NifU-like protein  48.53 
 
 		 81 aa  63.5  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3443  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.7 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775174 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.59 
 
 		 87 aa  63.5  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  45.31 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0669  nitrite reductase (NAD(P)H), small subunit  34.34 
 
 		 123 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.163122  normal  0.0446226 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1502  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.165892 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.62 
 
 		 72 aa  62.8  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  37.5 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0925  hypothetical protein  41.33 
 
 		 86 aa  62.8  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0198354 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1197  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.34 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.430122  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1109  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.73 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.442386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  44.29 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  45.95 
 
 		 74 aa  62.4  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.65 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  30.97 
 
 		 191 aa  61.6  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  45.59 
 
 		 80 aa  62  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  50 
 
 		 74 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0522  NifU domain-containing protein  37.33 
 
 		 80 aa  61.2  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  32.26 
 
 		 102 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0303  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.87 
 
 		 100 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000392242  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15130  thioredoxin-like protein  45.71 
 
 		 76 aa  61.6  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.206063 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2018  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.43 
 
 		 86 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.700022  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  43.55 
 
 		 81 aa  60.8  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0161  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.35 
 
 		 100 aa  60.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2324  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.77 
 
 		 96 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.575512  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  45.16 
 
 		 81 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.63 
 
 		 518 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  46.27 
 
 		 73 aa  60.1  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1653  NifU protein, putative  42.86 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.421868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.71 
 
 		 77 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0047  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.19 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  43.55 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0716  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.04 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.025133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  46.15 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0398  NifU protein, putative  42.86 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.939749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4762  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.04 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  50.94 
 
 		 331 aa  59.3  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0144  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.67 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1043  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.68 
 
 		 79 aa  59.7  0.00000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03310  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 		 585 aa  59.3  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  44.62 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  44.62 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  44.62 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>